четверг, 25 февраля 2016 г.

Род хеликобактер в систематике бактерий

К роду Helicobacter отнесены следующие виды бактерий: H. acinonychis, H. anseris, H. aurati, H. baculiformis, H. bilis, H. bizzozeronii, H. bovis, H. brantae, H. canadensis, H. canis, H. cetorum, H. cholecystus, H. cinaedi, H. cynogastricus, H. equorum, H. felis, H. fennelliae, H. ganmani, H. heilmannii, H. hepaticus, H. marmotae, H. mastomyrinus, H. mesocricetorum, H. muridarum, H. mustelae, H. pametensis, H. pullorum, H. pylori, H. rodentium, H. salomonis, H. suis, H. trogontum, H. typhlonius.

Род Helicobacter входит в семейство Helicobacteraceae, порядок Campylobacterales, класс Epsilonproteobacteria, тип Proteobacteria, царство Бактерии.

Виды, выявленные от крыс:
 H. bilis, H. muridarium, H. rodentium,
H. trogontum, H. typhlonius

Род Helicobacter было образовано за счёт выделенных нескольких видов из рода Campylobacter и полностью включённого в его состав рода Gastrospirillum:
  • к роду кампилобактер относились виды:
    • Helicobacter cinaedi (старое наименование Campylobacter cinaedi)
    • Helicobacter fennelliae (старое наименование Campylobacter fennelliae)
    • Helicobacter mustelae (старое наименование Campylobacter pylori subsp. mustelae)
    • Helicobacter pylori (старые наименования: Campylobacter pyloridis, Campylobacter pylori subsp. pylori)

  • к роду Gastrospirillum относились виды:
    • Helicobacter heilmannii (старое наименование Gastrospirillum hominis)
    • Helicobacter suis (старое наименование Gastrospirillum suis)
Остальные виды сформировались уже в рамках рода Helicobacter и количество их всё время увеличивается.

Таблица. Биохимический профиль, характеристика роста, морфология флагелл различных видов хеликобактерий*
Биохимический профиль, характеристика роста, морфология флагелл различных видов геликобактерий  (M.T. Whary, J.G. Fox)

На сайте www.gastroscan.ru в каталоге литературы имеется раздел «Helicobacter pylori», содержащий медицинские профессиональные статьи, посвященные заболеваниям ЖКТ, ассоциированным с Helicobacter pylori.

понедельник, 15 февраля 2016 г.

Хеликобактер у животных

Хеликобактер — нормальная микрофлора и возбудитель заболеваний органов пищеварения животных
От мышей выделено большое число видов геликобактерий: H. bilis, H. ganmani, H. hepaticus, H. muridarum, H. mastomyrinus, H. rappini, H. rodentium, H. typhlonius
От мышей выделено большое число видов геликобактерий: H. bilis, H. ganmani,
H. hepaticus, H. muridarum,
H. mastomyrinus, H. rappini,
H. rodentium, H. typhlonius

Разные представители рода Helicobacter обнаруживаются у млекопитающих и птиц, будучи у одних из них или в определённых условиях нормальной микрофлорой, а у других видов или в других условиях — возбудителями заболеваний. Например, Helicobacter heilmannii инфицирующая слизистую оболочку желудка кошек, собак, крыс, свиней, обезьян, гепардов. Местом постоянного обитания Helicobacter cinaedi является слизистая оболочка желудка и кишечника кошек, этот вид хеликобактера выделен у сирийские хомяков, собак, крыс, лис, макак резус. Helicobacter hepaticus был выделен из печени, желчного пузыря и кишечника кошек, собак, мышей и крыс, Helicobacter pullorum — из печени и кишечника кур, Helicobacter pametensis — из желудка птиц и свиней, Helicobacter mesocricetorum — из желудка хомяков и т.д.

От мышей выделены следующие виды хеликобактерий: H. bilis, H. ganmani, H. hepaticus, H. muridarum, H. mastomyrinus, H. rappini, H. rodentium, H. typhlonius. От крыс — H. bilis, H. muridarium, H. rodentium, H. trogontum, H. typhlonius.

Однако, например, достоверных данных о выделении каких-либо видов хеликобактерий от лошадей нет.

Некоторые виды хеликобактера, являющиеся патогенами для животных: Helicobacter bilis вызывает колит у собак, кошек и мышей, H. bizzozeronii, Н. felis, Н. heilmannii, Н. salomonis гастрит у кошек и собак, Н. pylory — гастрит у кошек, H. mustelae — язвенную болезнь желудка, хронический гастрит и аденокарциному и MALT-лимфому у хорьков и норок, Н. suis — язвенную болезнь желудка и гастрит у свиней. С клиническими заболеваниями мышей и крыс ассоциированы H. bilis и H. hepaticus.

Таблица.  Различные виды хеликобактера и животных, у которых они выявлены (а также человек), локализация различных видов хеликобактера*

Вид (таксон)ХозяеваПервичная локализацияВторичная локализация
H. acinonychisгепарды, тигрыжелудок-
H. auratiхомякижелудок, кишечник-
H. bilisмыши, собаки, крысы, кошки, песчанки, человеккишечникпечень (мыши), желчный пузырь (человек)
H. bizzozeroniiчеловек, кошки, собаки, гепарды, приматы, дикие крысыжелудок-
H. bovisкрупный рогатый скотсычуг-
H. canadensisчеловек, дикие гусикишечник-
H. canisчеловек, кошки, собакикишечникпечень (собаки)
H. cetorumдельфины, китыжелудок-
H. cholecystusхомякижелчный пузырь-
H. cinaediчеловек, хомяки, макаки, собакикишечниккровь, мозг, суставы (человек), печень (макаки)
H. felisкошки, собаки, человекжелудок-
H. fennelliaeчеловеккишечник-
H. ganmaniмышикишечник-
H. hepaticusмыши, песчанкикишечник-
H. marmotaeсевероамериканские лесные сурки, кошкикишечникпечень (североамериканские лесные сурки)
H.mesocricetorumхомякикишечник-
H. muricola**корейские дикие мышикишечник-
H. muridarumмыши, крысыкишечникжелудок (мыши)
H. mustelaeхорьки, норкижелудок-
H. pametensisдикие птицы, свиньикишечник-
H. pullorumчеловек, курыкишечникпечень (куры)
H. pyloriчеловек, приматы, кошкижелудок-
H. rappini**человек, кошки, собаки, мыши, овцы, свиньикишечникпланцета, плод, печень (овцы), кровь (человек)
H. rodentiumмыши, крысыкишечник-
H. salomonisсобакижелудок-
H. suisсвиньижелудок-
H. suncus**гигантские белозубкижелудок-
H. trogontumкрысыкишечник-
H. typhloniusмыши, крысыкишечник-
H.winghamensis**человеккишечник-

среда, 3 февраля 2016 г.

Хеликобактер — возбудитель заболеваний человека

Хеликобактер — возбудитель заболеваний верхних отделов желудочно-кишечного тракта человека
Более 10 видов хеликобактерий являются патогенными для человека (H. pylori, H. heilmannii, H. cinaedi, H. fennelliae, H. bilis, H. pullorum, H. hepaticus и др.).

Язва желудка человека
Язва желудка человека
Наиболее известным и клинически значимым для человека является вид хеликобактер пилори (Helicobacter pylori) (см.), с которым, по современным представлениям, связаны многие случаи язв желудка и двенадцатиперстной кишки человека, а также гастритов, MALT-ом и рака желудка.

Вторым по важности для человека видом хеликобактера является Helicobacter heilmannii. Он встречается у 0,25-1,7 % населения Земли (в Китае — до 6 %) и обычно вызывает антральный гастрит.

Заражение человека иными видами, обитающими у животных и птиц происходит или фекально-оральным путём, или при употреблении инфицированных продуктов животноводства и птицеводства в пищу, или в процессе общения с инфицированными животными и птицами.
Хеликобактер — возбудитель других заболеваний человека
Helicobacter cinaedi и Helicobacter fennelliae отнесены к возбудителям инфекций, передающихся половым путём, в частности при гомосексуальных сношениях у мужчин они могут быть причиной заражения проктитом или колитом. Эти виды также могут вызывать бактериемии у пациентов с иммунодефицитами.

Имеются данные, что Helicobacter bilis может ассоциироваться с раком желчного пузыря и раком желчных протоков человека.

вторник, 26 января 2016 г.

Хеликобактер (Helicobacter), род бактерий



Наиболее известный хеликобактер - Helicobacter pyloriХеликобактер, геликобактер, геликобактерии или хеликобактерии (лат. Helicobacter) — род спиралевидных грамотрицательных подвижных микроаэрофильных бактерий, разные виды которого могут инфицировать слизистую оболочку желудка или кишечника, ануса, желчного пузыря, желчевыводящих путей, а также печень человека и/или животных и могут вызывать различные воспалительные заболевания, такие как гастриты, язвенную болезнь желудка и двенадцатиперстной кишки, колиты, проктиты и другие.

В отношении написания наименования данного рода бактерий на русском языке см. Циммерман Я.С. Нерешенные и спорные проблемы современной гастроэнтерологии.
«Энтерогепатические» и «желудочные» хеликобактеры
Бактерии их рода Helicobacter, в зависимости их локализации в организме хозяина, условно разделяют на «энтерогепатические» и «желудочные»:
  • H. mustelae - желудочный вид хеликобактерий, возбудитель гастритов и пептической язвы хорьков
    Большое число хорьков являются
    носителями H. mustelae — «желудочного» вида хеликобактерий, ассоциируемого с
    гастритом и пептической язвой у норок, горностаев и хорьков

    «желудочные» виды: клинически важнейший вид Helicobacter pylori, а также H. acinonychis, H. baculiformis, H. bizzozeronii, H. cetorum, H. cynogastricus, H. felis, H. heilmannii, H. mustelae, H. salomonis, H. suis и другие; «желудочные» хеликобактерии выделяются из слизистой оболочки желудка человека или животных, таких видов относительно немного, но в заболеваниях человека они играют главнейшую роль

  • «энтерогепатические» виды: H. anseris, H. bilis, H. brantae, H. canis, H. canadensis, H. cholecystus, H. cinaedi, H. equorum, H. fennelliae, H. ganmani, H. hepaticus, H. marmotae, H. mastomyrinus, H. mesocricetorum, H. muridarum, H. pametensis,   H. pullorum, H. rodentium, H. salomonis, H. trogontum, H. typhlonius и другие; большинство видов хеликобактера является «энтерогепатическими» и обычно выделяются из слизистой оболочки кишечника, желчного пузыря, желчевыводящих путей, из печени организма хозяина. Большинство «энтерогепатических» хеликобактеров уреазоотрицательные и толерантны к действию желчи, что отличает их от «желудочных». Однако, подобное разделение не абсолютно. Иногда «энтерогепатические» бактерии выделяются из слизистой желудка и наоборот.
Некоторые авторы разделяют виды хеликобактера на «желудочные» и «внежелудочные», при этом список последних фактически совпадает со списком «энтерогепатических» видов.

вторник, 12 января 2016 г.

Цитробактер фреунди (citrobacter freundii)

Citrobacter freundii — вид грамотрицательных, споронеобразующих, факультативно анаэробных бактерий. Представитель нормальной, условно-патогенной микрофлоры кишечника человека.

Citrobacter freundii в систематике бактерий
Вид citrobacter freundii относится к роду цитробактер (citrobacter), который входит в семейство энтеробактерии (enterobacteriaceae), порядок энтеробактерии (enterobacteriales), класс гамма-протеобактерии (γ proteobacteria), тип протеобактерии (proteobacteria), царство бактерии.

Citrobacter freundii — возбудитель заболеваний человека
Сitrobacter freundii имеется в толстой кишке у большинства здоровых людей. Однако, при попадании в другие органы, или при изменении (появлении дисбаланса) в составе микрофлоры кишечника, citrobacter freundii может стать причиной инфекционных гастроэнтеритов, острых кишечных инфекций, инфекций мочеполовой системы, желчного пузыря, среднего уха и других заболеваний.
Антибиотики, активные в отношении citrobacter freundii
Антибактериальные средства (из имеющих описание в данном справочнике), активные в отношении citrobacter freundii: левофлоксацин.

среда, 30 декабря 2015 г.

Цитробактер



citrobacter koseri (diversus)Цитробактер (лат. citrobacter) — род грамотрицательных, споронеобразующих, факультативно анаэробных бактерий. Представитель нормальной, условно-патогенной микрофлоры кишечника человека.
 Сitrobacter в систематике бактерий
Род цитробактер (citrobacter) входит в семейство энтеробактерии (enterobacteriaceae), порядок энтеробактерии (enterobacteriales), класс гамма-протеобактерии (γ proteobacteria), тип протеобактерии (proteobacteria), царство бактерии.

Род цитробактер включает следующие виды: citrobacter amalonaticus, citrobacter braakii, citrobacter farmeri, citrobacter freundii, citrobacter gillenii, citrobacter koseri, citrobacter murliniae, citrobacter rodentium, citrobacter sedlakii, citrobacter werkmanii, citrobacter youngae.
Сitrobacter — возбудитель заболеваний человека и животных
Цитробактер является одной из самых частых причин внутрибольничных ангиогенных инфекций и инфекций мочевыводящих путей. Цитробактер способен вызывать вспышки гастроэнтеритов и токсикоинфекций, внутрибольничные инфекции, менингиты, абсцессы мозга, урологические заболевания, гнойные инфекции и сепсис у детей и взрослых людей. В регионах России в последние годы периодически происходят массовые отравления, в том числе в детских учреждениях, вызванные цитробактером, основной причиной которых является нарушение технологии приготовления пищи.

Источником инфекции являются люди и животные. Механизм передачи цитробактера — фекально-оральный. Основной путь передачи — пищевой, через молоко, молочные продукты, масло, кондитерские изделия, мясо птиц и животных. У ослабленных детей раннего возраста возможен контактно-бытовой путь заражения через игрушки, предметы ухода, руки персонала.

Цитобактериоз может протекать по типу пищевого отравления в виде гастрита, энтерита или гастроэнтерита. Инкубационный период цитробактериоза от 2 до 5 часов.

Гастрит начинается остро с тошноты, повторной рвоты, боли в эпигастральной области. Температура тела, чаще всего, в пределах от 37–37,5 до 38–38,5 ° С. Симптомы отравления выражены умеренно. Продолжительность — 1–2 дня.

Гастроэнтерит начинается остро с тошноты, повторной рвоты, болей в животе. Стул частый, жидкий, иногда с примесью слизи, до 10 раз в сутки. Боль в животе в первые дни болезни может быть выраженной, локализуется преимущественно в эпигастральной области, при пальпации определяется болезненность по ходу тонкой кишки. Понос, чаще всего, на несколько часов опережает развитие симптомов отравления. Температура тела повышается до 38° С, сохраняется не более 5 дней. Прогноз благоприятный, продолжительность цитробактериоза — от 4 до 6 дней.

Диагноз на цитробактериоз устанавливается после проведения специальных лабораторных исследований.

Цитробактер способен самостоятельно или в ассоциации с другими микробами вызывать заболевания у домашних и диких животных, рыб и пчел. В современной России имеются прецеденты, когда циторбактер выявляли в фабрично изготовленном комбикорме. Корма, зараженные цитробактером или с подозрением на цитробактер требуют обязательной проварки при температуре не ниже 100° С не менее часа.

Рекомендуем материалы Роспотребнадзора «О профилактике пищевых отравлений и инфекционных болезней, передающихся с пищей» и ВОЗа «Руководство по безопасным пищевым продуктам для туристов».
Цитробактер в результатах анализа кала на дисбактериоз
При микробиологическом анализе кала цитробактер рассматривается в комплексе с другими условно-патогенными бактериями, относящимися к семейству энтеробактерий и входящими в состав нормальной микрофлоры кишечника человека (кроме цитробактера это клебсиелла, протей, гафния, серратия, морганелла, провиденция, энтеробактер и др). В норме общее количество этих бактерий (колониеобразующих единиц, КОЕ) в 1 г кала должно быть меньше 104. Большее количество перечисленных бактерий является признаком дисбактериоза.

При избыточном росте цитробактера, как следствии дисбактериоза, при медикаментозной терапии применяются различные пробиотки (Бифидумбактерин, Бифиформ, Лактобактерин, Ацилакт, Аципол и др.) и/или адекватные конкретному штамму цитробактера и причине дисбактериоза бактериофаги и антибиотики.

На сайте www.gastroscan.ru в каталоге литературы имеется раздел «Дисбиоз» , содержащий статьи, затрагивающие проблемы дисбактериозов органов ЖКТ.
Антибиотики, активные и неактивные в отношении цитробактера
Антибактериальные средства (из имеющих описание в данном справочнике), активные в отношении цитробактера: нифуроксазид, ципрофлоксацин. В отношении citrobacter koseri и citrobacter freundii активен левофлоксацин.

Цитробактер устойчив к рокситромицину.

пятница, 18 декабря 2015 г.

Коринебактерии дифтерии


Corynebacterium diphtheriaeCorynebacterium diphtheriae (называемая в прошлом дифтерийной палочкой) — вид грамположительных бактерий рода коринебактерии. Сorynebacterium diphtheriae — возбудители дифтерии. Имеют вид прямых, слегка изогнутых палочек, длиной от 1 до 8 мкм и толщиной от 0,3 до 0,8 мкм.
Corynebacterium diphtheriae в систематике бактерий
По современной классификации вид corynebacterium diphtheriae входит в род коринебактерии (лат. Corynebacterium), который относится к семейству Corynebacteriaceae, подпорядку Corynebacterineae, порядку Actinomycetales, классу Actinobacteria, типу Actinobacteria, царству Бактерии.
Статистика заболеваемости дифтерией
Согласно официальным данным, число зарегистрированных случаев заболеваний дифтерией в Российской Федерации за 2009 и 2010 годы, в том числе среди детей и подростков до 17 лет включительно, следующая:


Всего от 0 до 17 лет
год:
2009 2010 2009 2010
Российская Федерация 14 9 2 3
      Центральный ФО 6 1 1 0
             г. Москва 3 0 1 0
      Северо-Западный ФО 0 0 0 0
             г. Санкт-Петербург 0 0 0 0

За 2011 год зарегистрировано 7 случаев дифтерии — по 1 случаю в Удмуртской Республике, Пермском крае, Ивановской, Калужской, Московской, Оренбургской и Иркутской областях.
Антибиотики, активные в отношении corynebacterium diphtheriae
Антибактериальные средства (из имеющих описание в данном справочнике), активные в отношении corynebacterium diphtheriae: джозамицин, кларитромицин, ванкомицин, линкомицин. Corynebacterium diphtheriae резистентны к ципрофлоксацину.