среда, 30 декабря 2015 г.

Цитробактер



citrobacter koseri (diversus)Цитробактер (лат. citrobacter) — род грамотрицательных, споронеобразующих, факультативно анаэробных бактерий. Представитель нормальной, условно-патогенной микрофлоры кишечника человека.
 Сitrobacter в систематике бактерий
Род цитробактер (citrobacter) входит в семейство энтеробактерии (enterobacteriaceae), порядок энтеробактерии (enterobacteriales), класс гамма-протеобактерии (γ proteobacteria), тип протеобактерии (proteobacteria), царство бактерии.

Род цитробактер включает следующие виды: citrobacter amalonaticus, citrobacter braakii, citrobacter farmeri, citrobacter freundii, citrobacter gillenii, citrobacter koseri, citrobacter murliniae, citrobacter rodentium, citrobacter sedlakii, citrobacter werkmanii, citrobacter youngae.
Сitrobacter — возбудитель заболеваний человека и животных
Цитробактер является одной из самых частых причин внутрибольничных ангиогенных инфекций и инфекций мочевыводящих путей. Цитробактер способен вызывать вспышки гастроэнтеритов и токсикоинфекций, внутрибольничные инфекции, менингиты, абсцессы мозга, урологические заболевания, гнойные инфекции и сепсис у детей и взрослых людей. В регионах России в последние годы периодически происходят массовые отравления, в том числе в детских учреждениях, вызванные цитробактером, основной причиной которых является нарушение технологии приготовления пищи.

Источником инфекции являются люди и животные. Механизм передачи цитробактера — фекально-оральный. Основной путь передачи — пищевой, через молоко, молочные продукты, масло, кондитерские изделия, мясо птиц и животных. У ослабленных детей раннего возраста возможен контактно-бытовой путь заражения через игрушки, предметы ухода, руки персонала.

Цитобактериоз может протекать по типу пищевого отравления в виде гастрита, энтерита или гастроэнтерита. Инкубационный период цитробактериоза от 2 до 5 часов.

Гастрит начинается остро с тошноты, повторной рвоты, боли в эпигастральной области. Температура тела, чаще всего, в пределах от 37–37,5 до 38–38,5 ° С. Симптомы отравления выражены умеренно. Продолжительность — 1–2 дня.

Гастроэнтерит начинается остро с тошноты, повторной рвоты, болей в животе. Стул частый, жидкий, иногда с примесью слизи, до 10 раз в сутки. Боль в животе в первые дни болезни может быть выраженной, локализуется преимущественно в эпигастральной области, при пальпации определяется болезненность по ходу тонкой кишки. Понос, чаще всего, на несколько часов опережает развитие симптомов отравления. Температура тела повышается до 38° С, сохраняется не более 5 дней. Прогноз благоприятный, продолжительность цитробактериоза — от 4 до 6 дней.

Диагноз на цитробактериоз устанавливается после проведения специальных лабораторных исследований.

Цитробактер способен самостоятельно или в ассоциации с другими микробами вызывать заболевания у домашних и диких животных, рыб и пчел. В современной России имеются прецеденты, когда циторбактер выявляли в фабрично изготовленном комбикорме. Корма, зараженные цитробактером или с подозрением на цитробактер требуют обязательной проварки при температуре не ниже 100° С не менее часа.

Рекомендуем материалы Роспотребнадзора «О профилактике пищевых отравлений и инфекционных болезней, передающихся с пищей» и ВОЗа «Руководство по безопасным пищевым продуктам для туристов».
Цитробактер в результатах анализа кала на дисбактериоз
При микробиологическом анализе кала цитробактер рассматривается в комплексе с другими условно-патогенными бактериями, относящимися к семейству энтеробактерий и входящими в состав нормальной микрофлоры кишечника человека (кроме цитробактера это клебсиелла, протей, гафния, серратия, морганелла, провиденция, энтеробактер и др). В норме общее количество этих бактерий (колониеобразующих единиц, КОЕ) в 1 г кала должно быть меньше 104. Большее количество перечисленных бактерий является признаком дисбактериоза.

При избыточном росте цитробактера, как следствии дисбактериоза, при медикаментозной терапии применяются различные пробиотки (Бифидумбактерин, Бифиформ, Лактобактерин, Ацилакт, Аципол и др.) и/или адекватные конкретному штамму цитробактера и причине дисбактериоза бактериофаги и антибиотики.

На сайте www.gastroscan.ru в каталоге литературы имеется раздел «Дисбиоз» , содержащий статьи, затрагивающие проблемы дисбактериозов органов ЖКТ.
Антибиотики, активные и неактивные в отношении цитробактера
Антибактериальные средства (из имеющих описание в данном справочнике), активные в отношении цитробактера: нифуроксазид, ципрофлоксацин. В отношении citrobacter koseri и citrobacter freundii активен левофлоксацин.

Цитробактер устойчив к рокситромицину.

пятница, 18 декабря 2015 г.

Коринебактерии дифтерии


Corynebacterium diphtheriaeCorynebacterium diphtheriae (называемая в прошлом дифтерийной палочкой) — вид грамположительных бактерий рода коринебактерии. Сorynebacterium diphtheriae — возбудители дифтерии. Имеют вид прямых, слегка изогнутых палочек, длиной от 1 до 8 мкм и толщиной от 0,3 до 0,8 мкм.
Corynebacterium diphtheriae в систематике бактерий
По современной классификации вид corynebacterium diphtheriae входит в род коринебактерии (лат. Corynebacterium), который относится к семейству Corynebacteriaceae, подпорядку Corynebacterineae, порядку Actinomycetales, классу Actinobacteria, типу Actinobacteria, царству Бактерии.
Статистика заболеваемости дифтерией
Согласно официальным данным, число зарегистрированных случаев заболеваний дифтерией в Российской Федерации за 2009 и 2010 годы, в том числе среди детей и подростков до 17 лет включительно, следующая:


Всего от 0 до 17 лет
год:
2009 2010 2009 2010
Российская Федерация 14 9 2 3
      Центральный ФО 6 1 1 0
             г. Москва 3 0 1 0
      Северо-Западный ФО 0 0 0 0
             г. Санкт-Петербург 0 0 0 0

За 2011 год зарегистрировано 7 случаев дифтерии — по 1 случаю в Удмуртской Республике, Пермском крае, Ивановской, Калужской, Московской, Оренбургской и Иркутской областях.
Антибиотики, активные в отношении corynebacterium diphtheriae
Антибактериальные средства (из имеющих описание в данном справочнике), активные в отношении corynebacterium diphtheriae: джозамицин, кларитромицин, ванкомицин, линкомицин. Corynebacterium diphtheriae резистентны к ципрофлоксацину.

среда, 9 декабря 2015 г.

Коринебактерии



коринебактерииКоринебактерии (лат. corynebacterium) — род грамположительных палочкообразных бактерий.

Коринебактерии вида corynebacterium diphtheriae являются возбудителями одной из наиболее известных инфекций человека — дифтерии.

Коринебактерии присутствуют в норме в толстой кишке человека (Ардатская М. Д., Минушкин О. Н.).

В зависимости от биологических особенностей разные виды коринебактерий способны поражать кожу и внутренние органы, особенно у пожилых людей, пациентов с иммуносупрессией или мультиорганной патологией. В случаях инфицирования венозных или брюшных катетеров, нейрохирургических шунтов наблюдается бактериемия. Многие представители коринебактерий становятся причиной эндокардитов, пневмоний, септического артрита и остеомиелита, инфекций при протезировании, заболеваний мочеполовой системы.

Непатогенные виды коринебактерий используются в промышленности для производства аминокислот, нуклеотидов, ферментов, биоконверсии стероидов и производстве сыров.  Одним из наиболее изученных видов коринебактерий corynebacterium glutamicum применяется при биосинтезе глютаминовой кислоты.

Виды Corynebacterium ammoniagenes и Corynebacterium flavescens разрешены СанПиН 2.3.2.2340-08, утвержденным Постановлением Главного государственного санитарного врача РФ 18 февраля 2008 г. № 13, для использования в пищевой промышленности.
Коринебактерии (corynebacterium) в систематике бактерий
По современной классификации род коринебактерии входит в семейство Corynebacteriaceae, подпорядок Corynebacterineae, порядок Actinomycetales, класс Actinobacteria, тип Actinobacteria, царство Бактерии.

corynebacterium ulceransВ род коринебактерии входят следующие виды: C. accolens, C. afermentans, C. ammoniagenes, C. amycolatum, C. argentoratense, C. appendicis, C. aquilae, C. auris, C. atypicum, C. aurimucosum,  C. auriscanis, C. bovis, C. diphtheriae, C. equi, C. flavescens, C. glucuronolyticum, C. glutamicum, C. granulosum, C. haemolyticum, C. halofytica, C. jeikeium, C. macginleyi, C. matruchotii,  C. minutissimum, C. parvum, C. propinquum, C. pseudodiphtheriticum, C. pseudotuberculosis, C. pyogenes, C. urealyticum, C. renale, C. spec, C. striatum, C. tenuis, C. ulcerans, C. urealyticum, C. xerosis.

Большинство видов коринебактерий являются нелиполитическими. Нелиполитические бактерии подразделяются на ферментирующие и неферментирующие: 
  • Нелиполитические коринебактерии
    • Ферментирующие коринебактерии:
      • Corynebacterium diphtheriae group
      • Corynebacterium xerosis
      • Corynebacterium striatum
      • Corynebacterium minutissimum
      • Corynebacterium amycolatum
      • Corynebacterium glucuronolyticum
      • Corynebacterium argentoratense
      • Corynebacterium matruchotii
    • Неферментирующие коринебактерии:
      • Corynebacterium afermentans subsp. afermentans
      • Corynebacterium auris
      • Corynebacterium pseudodiphtheriticum
      • Corynebacterium propinquum
  • Липолитические коринебактерии
      • Corynebacterium jeikeium
      • Corynebacterium urealyticum
      • Corynebacterium afermentans subsp. lipophilum
      • Corynebacterium accolens
      • Corynebacterium macginleyi
      • CDC coryneform groups F-1 и G
Антибиотики, активные в отношении коринебактерий
Антибактериальные средства (из имеющих описание в данном справочнике), активные в отношении коринебактерий: кларитромицин, азитромицин. Ванкомицин и джозамицин активны в отношении corynebacterium diphtheriae. Коринебактерии резистентны к ципрофлоксацину.

воскресенье, 29 ноября 2015 г.

Возбудитель внутрибольничных инфекций Acinetobacter baumannii


Acinetobacter baumannii Acinetobacter baumannii — вид грамотрицательных споронеобразующих неферментирующих строго аэробных бактерий.

Acinetobacter baumannii широко распространены в природе, а также во внутрибольничной среде и обладают множественными механизмами резистентности к антибиотикам. Acinetobacter baumannii могут колонизировать желудочно-кишечный тракт, кожу пациента, рото- и носоглотку, конъюнктиву, влагалище и уретру.

В то же время Acinetobacter baumannii могут являться причиной пневмонии, трахеобронхита, сепсиса, инфекций мочевыводящих путей, эндокардита, раневой и хирургической инфекции, инфекций кожи и мягких тканей (включая некротизирующий фасциит), менингита, вентрикулита, абсцессов мозга, интраабдоминальных абсцессов, хориоамнионита, остеомиелита, артрита, синусита и перитонита.
Acinetobacter baumannii — возбудитель внутрибольничных инфекций
Проблема нозокомиальных (внутрибольничных) инфекций, вызываемых Acinetobacter baumannii, становится всё более актуальной из-за растущей резистентности данных микроорганизмов к антибактериальным препаратам. Резистентность Acinetobacter baumannii к цефтазидиму и ампициллину/сульбактаму за 5 лет увеличилась в 2–2,5 раза, к амикацину и ципрофлоксацину — в 8–9 раз. Встречаются штаммы, резистентные ко всем применяемым антибактериальным препаратам. Появление таких устойчивых внутрибольничных микроорганизмов связано с необоснованным и неограниченным использованием антибиотиков.

Acinetobacter baumannii вызывает 2-10 % всех грамотрицательных инфекций в Европе и США и до 1% всех внутрибольничных инфекций. В России Acinetobacter baumannii, наряду с Pseudomonas aeruginosa и Klebsiella pneumoniae, относится к трём самым часто происходящим и опасным возбудителям нозокомиальных инфекций. Во внутрибольничных условиях вспышки инфекций, вызываемые Acinetobacter baumannii в 60% случаев происходят во «взрослых» отделениях реанимации и интенсивной терапии. Оставшиеся 40% приходятся на отделения реанимации и интенсивной терапии новорожденных, ожоговые, нейрохирургические, хирургические, онкологические и гематологические отделения. Способствующими факторами являются: организация работы в этих отделениях – широкое использование инвазивных диагностических и лечебных мероприятий (катетеризация магистральных сосудов, искусственная вентиляция лёгких, длительная инфузионная терапия, энтеральное питание, методы внепочечного очищения крови), высокая концентрация больных с тяжелыми заболеваниями и сниженной иммунологической защитой, широкое и часто нерациональное использование антибактериальных и кортикостероидных препаратов, цитостатиков. Acinetobacter baumannii в большинстве случаев вызывает заболевания у тяжелобольных иммуноскомпрометированных пациентов (Ю.Л. Горбич, И.А. Карпов, 2012).
Acinetobacter baumannii в систематике бактерий
По современным представлениям вид Acinetobacter baumannii входит в род ацинетобактеры (лат. Acinetobacter), который относится к семейству Moraxellaceae, порядку Pseudomonadales, классу гамма-протеобактерии (Gamma proteobacteria), типу протеобактерии (Proteobacteria), царству бактерии.
Антибиотики, активные в отношении Acinetobacter baumannii
В течение многих лет основой терапии инфекций, вызванных Acinetobacter baumannii, были бета-лактамные антибиотики, часто в сочетании с аминогликозидами в случаях тяжелых инфекций. Однако большинство внутрибольничных Acinetobacter baumannii в настоящее время устойчивы к этим препаратам. Фторхинолоны, тетрациклины и глицилциклин, триметоприм-сульфаметоксазол, карбапенемы (за исключением эртапенема), полимиксины могут сохранять активность в отношении некоторых внутрибольничных штаммов. Однако в большинстве стран наблюдается быстрое нарастание резистентности к этим группам антибиотиков. В настоящее время наиболее клинически и финансово эффективным является использование монотерапии ампициллином/сульбактамом в дозах 24 г/сут или комбинированных режимов, включающих карбапенемы и ампициллин/сульбактам или карбапенемы и цефоперазон/сульбактам и нетилмицин. Последняя комбинация является экономически менее выгодной (Н.Д. Дмитриева и др., 2012).

Из представленных в данном справочнике антимикробных средств в отношении Acinetobacter baumannii (в общем) активны: левофлоксацин, нифурател, доксициклин. Acinetobacter baumannii устойчив к рокситромицину.

четверг, 19 ноября 2015 г.

Чумная палочка



Yersinia pestis - чумная палочкаЧумная палочка (Yersinia pestis) — вид грамотрицательных споронеобразующих бактерий, факультативных анаэробов. Возбудитель бубонной чумы, пневмонии (легочной формы чумы) и септической чумы.
Yersinia pestis в систематике бактерий
Вид иерсиния пестис (чумная палочка) относится к роду иерсинии (Yersinia), который входит в семейство энтеробактерии (Enterobacteriaceae), порядок энтеробактерии (Enterobacteriales), класс гамма-протеобактерии (γ proteobacteria), тип протеобактерии (Proteobacteria), царство бактерии.
Антибиотики, активные в отношении Yersinia pestis
Антибактериальные средства (из имеющих описание в данном справочнике), активные в отношении Yersinia pestis: доксициклин, тетрациклин.
Чума человека
У человека чума характеризуется внезапным повышением температуры и недомоганием, которое может сопровождаться болью в животе, тошнотой и рвотой. Есть три основные формы чумы, зависящие от способа заражения:
  • Бубонная чума, как результат укуса инфицированной блохи, составляет примерно 80% -85% случаев; у пациентов развивается болезненный отек одного или нескольких лимфатических узлов, прогрессирующий в течение первых нескольких дней болезни.
  • Септическая чума, что составляет примерно 10% случаев, которая может произойти от блошиного укуса или от прямого контакта с инфицированными жидкостями; инфекция распространяется непосредственно через кровь без каких-либо локализующих признаков.
  • Лёгочная чума. Первичная легочная чума происходит примерно в 3% заболеваний чумой; возникает в результате аэрозольного воздействия инфекционный капель и характеризуется молниеносной первичной пневмонией. Вторичная легочная чума может возникнуть от распространения Yersinia pestis в легкие больного с необработанной бубонной или септической инфекцией.
Смертность от чумы при отсутствии лечения составляет от 63 % до 93%. При лечении современными антибиотиками — примерно 16 %. Своевременное лечение с применением антимикробных препаратов, таких как аминогликозиды, фторхинолоны или доксициклин, значительно увеличивает вероятность благоприятного исхода.
Чума человека в США
Согласно релиза Centers for Disease Control and Prevention (CDC), США от 25 августа 2015 года в США за период с 2001 по 2012 годы в год регистрировалось от 1 до 17 случаев заражения людей чумой (в среднем три случая в год). В период с 1 апреля 2015 года (до 25 августа 2015) зарегистрировано 11 случаев чумы человека в 6 штатах (возбудитель Yersinia pestis). 2 случая связывают с посещением Национального парка Йосемити в Калифорнии. 3 больных (возраст 16, 52 и 79 лет) скончались. Причина резкого увеличения заболеваемости чумой в 2015 году в США, как отмечается в упомянутом релизе, не понятна.
Yersinia pestis в МКБ-10
Yersinia pestis упоминается Международной классификации болезней МКБ-10 в «Классе I. Некоторые инфекционные и паразитарные болезни», в блоке «A20-A28 Некоторые бактериальные зоонозы», где имеется трёхсимвольная рубрика «A20 Чума» с расшифровкой, что в неё включена инфекция, вызванная Yersinia pestis. В эту рубрику входят четырёхсимвольные рубрики:
  • A20.0 Бубонная чума
  • A20.1 Целлюлярнокожная чума
  • A20.2 Лёгочная чума
  • A20.3 Чумной менингит
  • A20.7 Септическая чума
  • A20.8 Другие формы чумы  (с расшифровкой: Абортивная чума. Бессимптомная чума .Малая чума)
  • A20.9 Чума неуточнённая
Небольшая мутация Yersinia pestis изменила историю человечества?
В статье, опубликованной в 2015 году в журнале Nature Communications, Dr. D.Zimbler и Dr. W. Lathem из Northwestern University (США) описали обнаруженную ими единственную генетическую особенность Yersinia pestis, которая принципиально изменила в свое время ход эволюции микроорганизма и историю человечества. В прошлом Yersinia pestis  не могла вызвать лёгочные формы чумы. Приобретение единственного гена  поверхностного белка Pla привело к превращению Yersinia pestis из патогена, вызывающего кишечные инфекционные заболевания, в микроорганизм, связанный с развитием тяжелых и летальных инфекций органов дыхания.

четверг, 8 октября 2015 г.

Фузобактерии (fusobacterium)

Фузобактерии (лат. fusobacterium) — род грамотрицательных анаэробных неспорообразующих бактерий. Фузобактерии полиморфны, часто имеют форму толстых длинных палочек с заостренными концами размером 0,5–1 на 2–3 мкм. Фузобактерии не имеют жгутиков и не образуют капсул.
Фузобактерии в классификации бактерий
По современной классификации род фузобактерии входит в семейство Fusobacteriaceae, порядок Fusobacteriales, класс Fusobacteria, тип Fusobacteria, царство Бактерии. В состав рода фузобактерии входят виды: F. onadiaformans, F. mortiferum, F. naviforme, F. necrogenes, F. necrophorum, F. nucleatum, F. periodonticum, F. polymorphum, F. russii, F. ulcerans, F. varium. Из-за своей близости к бактероидам ранее род фузобактерий относился к семейству бактероидов (Bacteroidaceae), однако позже был отнесен к семейству Fusobacteriaceae. Одно время включаемый в род фузобактерий вид fusobacterium sulci сейчас отнесен к роду эубактерий и классифицируется как eubacterium sulci.
Фузобактерии — нормальная микрофлора человека
Основные места обитания фузобактерий в человеческом организме — толстая кишка и респираторный тракт. В кале здоровых людей обнаруживается следующее количество фузобактерий:
  • у детей раннего возраста — 108–109 КОЕ/г
  • у взрослых — 107–1010 КОЕ/г
  • у пожилых — 108–109 КОЕ/г.
В норме у взрослого человека в полости рта в титре содержится 102–104 КОЕ/г фузобактерий.

Согласно современным представлениям, бактерии рода Fusobacterium относятся к основной резидентной микрофлоре желудка здорового человека, при условии отсутствия в нём Helicobacter pylori в доминирующем количестве (Engstrand L., 2012).
Фузобактерии — возбудители заболеваний
Некоторые виды фузобактерий являются условно-патогенными и при имуннодефицитах могут вызывать вторичные гангренозные и гнойно-гангренозные процессы. При ангине, герпетическом стоматите, гипотрофии у детей, при имуннодефицитных состояниях возможно развитие фузоспирохетоза — некротического воспалительного процесса на миндалинах, слизистой оболочки полости рта.

Наиболее изучены свойства следующих видов фузобактерий:
  • fusobacterium necrophorum (ранее называемой палочкой Шморля) — представитель нормальной микрофлоры ротовой полости и кишечника человека, рубца жвачных животных, известен также как возбудитель копытной гнили (некробиоза) крупного рогатого скота;
  • fusobacterium nucleatum (палочка Плаута) — превалирующий компонент нормальной микрофлоры зубного налета и возбудитель заболеваний десен и других органов человека.
Профессиональные медицинские статьи, затрагивающие роль фузобактерий в заболеваниях человека
Лечение фузобактериозов
Фузобактерии лечатся, в основном, фосфимицином (торговые наименования: монурал, урофосфабол).
Антибиотики, активные и неактивные в отношении фузобактерий
Антибактериальные средства (из имеющих описание в данном справочнике), активные в отношении фузобактерий: метронидазол, тинидазол, клиндамицин.

Фузобактерии устойчивы к рокситромицину.

понедельник, 28 сентября 2015 г.

Патогенные кишечные палочки

Эшерихиозы
Патогенные серотипы кишечных палочек могут быть причиной эшерихиозов — различных инфекционных заболеваний, протекающих с интоксикацией, лихорадкой, обычно с поражением желудочно-кишечного тракта, реже — мочевыводящих, желчевыводящих путей, других органов или с развитием сепсиса. Эшерихиозы чаще встречаются у детей раннего возраста. Механизм распространения эшерихиозов ЖКТ — фекально-оральный. Чаще всего заражение происходит через загрязнённую пищу или воду. 

Рекомендуем материалы Роспотребнадзора «О профилактике пищевых отравлений и инфекционных болезней, передающихся с пищей» и ВОЗа «Руководство по безопасным пищевым продуктам для туристов».

Escherichia coli (кишечная палочка) — наиболее часто встречающийся возбудитель спонтанного бактериального перитонита — воспаления брюшной полости при отсутствие очевидного источника инфекции.
Энтеропатогенная кишечная палочка
escherichia coli Энтеропатогенная кишечная палочка часто обозначается аббревиатурой на латинице — ETEC. Кишечные инфекции, вызываемые энтеропатогенными штаммами кишечных палочек, развиваются чаще всего в тонкой кишке у детей первого года жизни, в том числе у новорождённых. Заболевание сопровождается сильным поносом с водянистым стулом без примеси крови, выраженными болями в животе, рвотой. Энтеропатогенные escherichia coli являются частой причиной диарей в родильных домах. Штаммы ETEC являются основной причиной развития острой водянистой диареи в развивающихся странах, особенно в теплый и влажный сезон. Как в развитых, так и в развивающихся странах штаммы энтеропатогенной кишечной палочки являются наиболее распространенной причиной «диареи путешественников», которая обычно проходит без лечения.

Энтеропатогенная кишечная палочка имеет два важных фактора вирулентности:
  • фактор колонизации, за счет которых происходит прилипание ETEC к энтероцитам тонкой кишки
  • токсический фактор: штаммы ETEC продуцируют термолабильные (LT) и/или термостабильные (ST) энтеротоксины, вызывающие секрецию сока и электролитов, что приводит к водянистой диарее. ETEC не разрушают кисточковую кайму и не внедряются в слизистую оболочку кишечника
Энтеротоксигенная кишечная палочка
Энтеротоксигенные кишечные палочки обладают способностью прикрепляться к эпителиальным клеткам слизистой оболочки тонкой кишки и продуцировать токсины, вызывающих диарею. Энтеротоксигенные кишечные палочки являются основной причиной острых диарей  у детей и взрослых и наиболее частой причиной так называемой «диареей путешественников».
Энтерогеморрагическая кишечная палочка 
Энтерогеморрагические кишечные палочки (EHEC) являются причиной геморрагического колита, а также тяжелого заболевания — гемолитико-уремического синдрома (микроангиопатической гемолитической анемии, сочетающейся с почечной недостаточностью; аббревиатура ГУС или HUS).

Для геморрагического колита характерно острое начало в виде сильных спастических болей в животе и водной диареи, которая вскоре становится кровавой. Лихорадка обычно отсутствует, но у некоторых температура тела может достигать 39 °С. В легких случаях геморрагический колит продолжается 7–10 дней. Приблизительно в 5 % случаев геморрагический колит осложняется геморрагическим синдромом, острой почечной недостаточностью и гемолитической анемией.

Источником инфекции мая 2011 года в Германии и других европейских странах являлся штамм продуцирующей шига-токсин STEC (синоним: продуцирующей веротоксин - VTEC) энтерогеморрагической кишечной палочки.

Шига-токсинЗаражение STEC или VTEC-кишечной палочкой происходит чаще всего через продукты питания или при близком контакте с больными людьми или животными. Для начала заболевания достаточно небольшого числа STEC/VTEC Escherichia coli.

Установлено, что возбудителем европейской инфекции мая 2011 года является кишечная палочка серологической группы E. coli O104 (серотип E. coli O104:H4), имеющая в своем геноме ген, ответственный за продукцию шига-подобного токсина 2-го типа. В отличие от классических энтерогеморрагических кишечных палочек (E. coli О157:Н7), штаммы E.coli O104:H4 не имеют еае-гена, ответственного за продукцию белка интимина, который является фактором  адгезии.

Штаммы E. coli O104:H4, выделенные от пациентов, характеризовались  резистентностью к бета-лактамным антибиотикам за счет продукции бета-лактамазы расширенного спектра, но оставались чувствительными к группе аминогликозидов (гентамицин)  и фторхинолонам.

После заражения энтерогеморрагической кишечной палочкой инкубационный период длится чаще всего от 48 до 72 часов, но может быть и от 1 до 10 дней. Симптомы заражения  включают схваткообразные боли в животе и диарею, нередко с кровью. Могут наблюдаться лихорадка и рвота. Большинство больных выздоравливают в течение 10 дней. Иногда инфекция может приводить к опасным для жизни состояниям, таким как гемолитико-уремический синдром.

См. также:
Энтероинвазивная кишечная палочка
Энтероинвазивная кишечная палочка часто обозначается аббревиатурой на латинице — EIEC. Энтероинвазивные кишечные палочки являются причиной заболеваний, похожих по проявлению на бактериальную дизентерию (причиной которой являются шигеллы). Штаммы EIEC подобны штаммам Shigella как биохимически, так и серологически. Как и в случае Shigella, энтероинвазивные кишечные палочки проникают в эпителиальные клетки ободочной кишки и размножаются там. У больного отмечаются боли в животе, обильный водянистый понос с примесью крови. В развивающихся странах штаммы EIEC встречаются редко. Они служат причиной возникновения периодических вспышек инфекций пищевого происхождения среди детей и взрослых. Симптомы заболевания имеют много общего с проявлениями шигеллёза. Предположительно против EIEC эффективны те же антибиотики, что и против Shigella при условии сохранения чувствительности этого штамма на той или иной территории, однако результативность терапии еще никогда не оценивалась в рамках контролируемых исследований.
Escherichia coli — возбудитель заболеваний мочеполовых органов
Инфицирование кишечными палочками (а также другими уропатогенными микробами, обитающими в кишечнике) мочеполовых органов, особенно у женщин, часто происходит непосредственно из желудочно-кишечного тракта при недостаточном соблюдении гигиены или применении специфических сексуальных практик. Кишечные палочки являются причиной:
  • около 80 % внебольничных инфекций мочевыводящих путей
  • 64 % всех заболеваний острым простатитом
  • 80 % всех хронических простатитов
  • для пациентов старше 35 лет — большей части всех эпидидимитов (воспалительный процесс в придатке яичка), орхитов (воспаление яичка) и эпидидимоорхитов (сочетанное воспаление яичка и придатка яичка)
  • 70-95 % инфекций мочевых путей, достигающих мочевого пузыря или почки восходящим путем
  • других заболеваний мочеполовых органов.
Бактериурия — наличие бактерий в моче — может являться признаком воспаления в мочевыводящих путях, мочевом пузыре, почках. При отсутствии каких-либо симптомов, истинная бактериурия (инфекция мочевых путей) диагностируется при наличии не менее 105 микробных тел кишечных палочек (или других энтеробактерий) в 1 мл свежевыпущенной мочи, иначе предполагается, что загрязнение мочи происходит при ее заборе. Если бактериурия не сопровождается какими-либо симптомами, тогда она называется бессимптомной. Бессимптомная бактериурия не всегда требует немедленного лечения.

При наличии симптомов или при заборе мочи катетером диагностический порог может быть значительно уменьшен. В частности, при наличии клинической симптоматики (лихорадка, озноб, тошнота, рвота, боли в поясничной области, дизурия) и выделении не менее 10 лейкоцитов в 1 мкл мочи, критерием для диагностики острого пиелонефрита является наличие не менее 104 кишечных палочек (или других патогенных энтеробактерий) в 1 мл свежевыпущенной мочи. Острый цистит диагностируется при наличии  соответствующей клинической симптоматики, выделении не менее 10 лейкоцитов в 1 мкл мочи и обнаружении не менее 102 кишечных палочек (или других колиформных бактерий) в 1 мл мочи.

четверг, 17 сентября 2015 г.

Кишечная палочка (Escherichia coli). Общие сведения.


escherichia coliКишечная палочка (эшерихия коли, лат. Escherichia coli; общепринятое сокращение E. coli) — вид грамотрицательных палочковидных бактерий, входящий в состав нормальной микрофлоры желудочно-кишечного тракта человека.

Вид эшерихия коли (e. coli) входит в род эшерихии (лат. escherichia), семейство энтеробактерии (лат. enterobacteriaceae), порядок энтеробактерии (лат. enterobacteriales), класс гамма-протеобактерии (лат. γ proteobacteria), тип протеобактерии (лат. proteobacteria), царство бактерии.

Существует большое число разновидностей кишечной палочки (Escherichia coli), в том числе, более 100 патогенных («энтеровирулентных») типов, объединенных в четыре класса: энтеропатогенные, энтеротоксигенные, энтероинвазивные и энтерогеморрагические. Морфологические различия между патогенными и непатогенными эшерихиями отсутствуют.
Кишечные палочки. Общие сведения
Кишечные палочки (Escherichia coli) устойчивы  во внешней среде, длительное время сохраняются в почве, воде, фекалиях. Хорошо переносят высушивание. Кишечные палочки обладают способностью к размножению в пищевых продуктах, особенно в молоке. Быстро погибают при кипячении и воздействии дезинфицирующих средств (хлорной извести, формалина, фенола, сулемы, едкого натра и др.). escherichia coli Кишечные палочки более устойчивы во внешней среде по сравнению с другими энтеробактериями. Прямой солнечный свет убивает их в течение нескольких минут, температура 60°С и 1 % раствор карболовой кислоты — в течение 15 минут.

Часть кишечных палочек имеет жгутики и подвижны. У других кишечных палочек жгутики и способность к движению отсутствуют.
Escherichia coli в кишечнике и кале человека
Число кишечных палочек Escherichia coli среди других представителей микрофлоры кишечника не превышает 1%, но они играют важнейшую роль в функционировании желудочно-кишечного тракта. Кишечные палочки E. coli являются основными конкурентами условно-патогенной микрофлоры в отношении заселения ими кишечника. Кишечные палочки E.coli забирают из просвета кишечника кислород, который вреден для полезных для человека бифидо- и лактобактерий. Кишечные палочки e coli вырабатывают ряд необходимых для человека витаминов: В1, В2, В3, В5, В6, В9, B12, К, участвует в обмене холестерина, билирубина, холина, желчных и жирных кислот, оказывает влияние на всасывание железа и кальция.

Escherichia coli в кишечнике человека появляются в первые дни после рождения и сохраняются на протяжении жизни на уровне 106—108 КОЕ/г содержимого толстой кишки. В фекалиях здорового человека кишечные палочки (типичные) выявляются в количестве 107—108 КОЕ/г, при этом количество лактозонегативных кишечных палочек не должно превышать 105 КОЕ/г, а гемолитические кишечные палочки должны отсутствовать.

Отклонения от указанных значений является признаком дисбактериоза:
  • снижение типичных кишечных палочек до 105—106 КОЕ/г, или повышение содержания типичных эшерихий до 109—1010  КОЕ/г определяется, как первая степень микробиологических нарушений
  • повышение концентрации гемолитических кишечных палочек до до 105—107 КОЕ/г определяется, как вторая степень микробиологических нарушений
При избыточном росте кишечных палочек детям рекомендуется прием бактериофагов (в зависимости от типа кишечной палочки): бактериофаг коли жидкий, бактериофаг колипротейный жидкий, пиобактериофаг комбинированный жидкий, пиополифаг в таблетках, пиобактериофаг поливалентный очищенный жидкий или интести-бактериофаг жидкий.

При избыточном росте кишечной палочки, как следствии дисбактериоза, кроме бактериофагов, при медикаментозной терапии применяются различные пробиотки (Бифидумбактерин, Лактобактерин, Ацилакт, Аципол и др.) и/или адекватные конкретному штамму e. coli и причине дисбактериоза антибиотики (у взрослых).

На сайте www.gastroscan.ru в каталоге литературы имеется раздел «Дисбиоз», содержащий статьи, затрагивающие проблемы дисбактериозов органов ЖКТ

Штаммы Escherichia coli — пробиотики и компоненты лекарств
Хилак форте содержит штамм кишечной палочкиШтамм кишечной палочки Escherichia coli Nissle 1917 (DSM 6601) считается наиболее эффективным пробиотиком, помогающим уменьшить воспаление и оттянуть следующий приступ язвенного колита (Пробиотики. Что это такое и что они могут дать?). Этот штамм входит, в частности, в состав пробиотика Mutaflor (фирма Ardeypharm).

Специально подобранные штаммы эшерихии коли входят в состав лекарств: Хилак форте (штамм DSM 4087), Бификол (штамм М-17), Колибактерин (штамм М-17) и других.
Антибиотики, активные в отношении кишечной палочки
Антибактериальные средства (из имеющих описание в данном справочнике), активные в отношении кишечной палочки: амоксициллин, левофлоксацин, нифурателнифуроксазид, рифаксимин, фуразолидон, ципрофлоксацин, доксициклин (не все штаммы).
Escherichia coli в МКБ-10
Escherichia coli упоминается в Международной классификации болезней МКБ-10, в частности:

вторник, 8 сентября 2015 г.

Бактероиды фрагилис (Bacteroides fragilis)

Бактероиды фрагилис (лат. Bacteroides fragilis) — вид грамотрицательных анаэробных бактерий. Относятся к роду бактероиды (лат. Bacteroides), входящему в семейство Bacteroidaceae, порядок Bacteroidales, класс Bacteroidia, тип Bacteroidetes, царство Бактерии.

Синонимы (более ранние названия): Bacillus fragilis, Fusiformis fragilis, Ristella fragilis, Pseudobacterium fragilis, Bacteroides inaequalis, Sphaerophorus inaequalis, Pseudobacterium inaequalis, Bacteroides incommunis, Ristella incommunis, Pseudobacterium incommunis, Bacteroides uncatus,  Ristella uncata, Pseudobacterium uncatum, Sphaerophorus intermedius.

Бактероиды фрагилис — неподвижные, образующие капсулу бактерии. Капсулы обладают интенсивным свечением и значительной толщиной, превышая размер клетки в 3–6 раз.
Bacteroides fragilis — нормальная микрофлора человека
Основное место обитания Bacteroides fragilis в человеческом организме — толстая кишка. В кале здоровых людей Bacteroides fragilis составляют около половины всех микробных клеток. Bacteroides fragilis также входят в состав нормальной микрофлоры влагалища и вульвы, полости рта и гортани, верхних дыхательных путей человека. Bacteroides fragilis, как и другие бактероиды, у здоровых людей отсутствуют во  внутренних органах, не имеющих связанных с внешней средой полостей, и во внутрибрюшинном пространстве.
Bacteroides fragilis — возбудители заболеваний
Bacteroides fragilis, как и другие бактероиды, могут вызывать различные гнойно-воспалительные заболевания после травм, оперативных вмешательств, инструментальных исследований, при онкопатологиях или иммунодефиците.
 
Bacteroides fragilis могут быть причиной как внутрибрюшинных инфекций, таких как перитонит, хронический язвенный колит, так и синовиита, сальпингита, болезни Рейтера, хронического тонзиллита, цервицита, эндометрита, аднексита, инфекции в малом тазу, а также простатита, хронически протекающего осложнённого мужского уретрита.

Антибактериальные средства (из имеющих описание в данном справочнике), активные в отношении Bacteroides fragilis: метронидазол, тинидазол, рифаксимин, джозамицин, линкомицин, клиндамицин. Bacteroides fragilis резистентны к ципрофлоксацину, рокситромицину. Большинство штаммов Bacteroides fragilis устойчивы к доксициклину.
Bacteroides fragilis в МКБ-10
Bacteroides fragilis упоминаются в «Классе I. Некоторые инфекционные и паразитарные болезни (A00-B99)» Международной классификации болезней МКБ-10, они включены в блок «B95-B98 Бактериальные, вирусные и другие инфекционные агенты» и имеют код рубрики «B96.6 Bacteroides fragilis [B. fragilis] как причина болезней, классифицированных в других рубриках» (в оригинальном документе ВОЗ на английском языке употребляется синоним Bacillus fragilis). Данный код предназначен для использования в качестве дополнительного, когда целесообразно идентифицировать инфекционных агентов заболеваний, классифицированных в других рубриках.

понедельник, 31 августа 2015 г.

Антибиотики, активные и неактивные в отношении ацинетобактера

Необходимо отметить, что ацинетобактер отличаются высокой и поливалентной резистентностью к антибиотикам, что крайне затрудняет эффективное лечение больных (Гельфанд Е.Б. и др.).

A. Противомикробные средства из имеющих описание в данном справочнике

В отношении ацинетобактера активны:

Ацинетобактер, в общем, чувствителен к тетрациклину и доксициклину, однако многие штаммы приобрели устойчивость к этим препаратам и, их применение требует тестирования конкретных штаммов.

Ацинетобактер устойчив к: рокситромицину.

Б. Иные противомикробные препараты


Ацинетобактер умеренно чувствителен к цефалоспоринам IV поколения: цефепиму, цефпирому и другим (Яковлев С.В.).

Из карбапенемов в отношении ацинетобактера активны меропенем, имипенем, биапенем и панипенем. Эртапенем, наоборот, не активен (Белобородов В.Б.).

Ацинетобактер имеет высокий уровень устойчивости к фторхинолонам. В частности, к ципрофлоксацину на территории России в отделениях реанимации частота устойчивости варьирует от 13 до 53% (Сидоренко С.В.).

По мнению С.В. Яковлева, при выявленном возбудителе, препаратам первого ряда для лечения инфекции (мочевыводящих путей у больных пожилого возраста) ацинетобактера, являются фторхинолоны, в качестве альтернативных средств рекомендуются карбапенемы, амикацин и цефалоспорины IV поколения.

Ацинетобактер чувствителен к сульбактаму и к комбинации амоксициллин + сульбактам (Царапкин Г.Ю. и др.).

Виды ацинетобактера в общем резистентны к азтреонаму (R. de Groot).

пятница, 21 августа 2015 г.

Ацинетобактер - повсеместно встречающаяся бактерия

Ацинетобактер (англ. Acinetobacter) — род грамотрицательных споронеобразующих неферментирующих строго аэробных бактерий.

Acinetobacter — повсеместно встречающаяся бактерия. У здоровых людей, в частности, он обитает на коже, также выделяется из кишечника.
Ацинетобактер — причина внутрибольничных инфекций
Acinetobacter может вызывать у гостпитализированных пациентов инфекции дыхательных путей (синусит, трахеобронхит, пневмония), кровотока (сепсис, эндокардит естественных и искусственных клапанов), мочевыводящих путей, раневой и хирургической инфекций, инфекций кожи и мягких тканей (включая некротизирующий фасциит), нервной системы (менингит, вентрикулит, абсцесс мозга), интраабдоминальные (абсцессы различной локализации, перитонит), опорно-двигательного аппарата (остеомиелит, артрит). Наиболее значимым клинически видом рода Acinetobacter является Acinetobacter baumannii, который вызывает 2–10% грамотрицательных инфекций в Европе и США и до 1% всех нозокомиальных инфекций (Горбич Ю.Л. и др.).
Ацинетобактер в анализах кала
Согласно ОСТ 91500.11.0004-2003 «Протокол ведения больных. Дисбактериоз кишечника», общее количество неферментирующих бактерий, включая ацинетобактер и псеводомонады, в том числе синегнойную палочку, в 1 грамме кала здорового взрослого человека и ребёнка старше 1 года не должно превышать 104 колониеобразующих единицах (КОЕ), а у детей до 1 года — 103.
Ацинетобактер в систематике бактерий
Род Acinetobacter относится к семейству Moraxellaceae, которое входит в порядок Pseudomonadales, класс гамма-протеобактерии (γ proteobacteria), тип протеобактерии (Proteobacteria), царство бактерии.

В род ацинетобактер включены следующие виды: Acinetobacter baumannii, Acinetobacter baylyi, Acinetobacter beijerinckii, Acinetobacter bereziniae, Acinetobacter bohemicus, Acinetobacter boissieri, Acinetobacter bouvetii, Acinetobacter brisouii, Acinetobacter calcoaceticus, Acinetobacter endosymbiont of Anopheles claviger, Acinetobacter endosymbiont of Culex pipiens, Acinetobacter endosymbiont of Nilaparvata lugens, Acinetobacter genospecies, Acinetobacter gerneri, Acinetobacter glutaminasificans, Acinetobacter guillouiae, Acinetobacter gyllenbergii, Acinetobacter haemolyticus, Acinetobacter indicus, Acinetobacter johnsonii, Acinetobacter junii, Acinetobacter kyonggiensis, Acinetobacter lwoffii, Acinetobacter marinus, Acinetobacter nectaris, Acinetobacter nosocomialis, Acinetobacter oleivorans, Acinetobacter parvus, Acinetobacter pittii, Acinetobacter psychrotolerans, Acinetobacter puyangensis, Acinetobacter radioresistens, Acinetobacter rhizosphaerae, Acinetobacter rudis, Acinetobacter schindleri, Acinetobacter seohaensis, Acinetobacter septicus, Acinetobacter soli, Acinetobacter tandoii, Acinetobacter tjernbergiae, Acinetobacter towneri, Acinetobacter ursingii, Acinetobacter venetianus, Acinetobacter xiamenensis.

Ряд видов, а именно: Acinetobacter baumannii, Acinetobacter calcoaceticus, Acinetobacter nosocomialis, Acinetobacter pittii объединены в отдельную группу Acinetobacter calcoaceticus/baumannii complex.

понедельник, 10 августа 2015 г.

Rothia mucilaginosa

Rothia mucilaginosa — вид грамположительных неподвижных бактерий из семейства Micrococcaceae. Располагаются парами, тетрадами и кластерами. Оптимальная температура роста 30-37 ° С.

В прошлом вид Rothia mucilaginosa назывался Stomatococcus mucilaginosus и Micrococcus mucilaginosus.

Rothia mucilaginosa нормальная микрофлора и причина заболеваний человека
Rothia mucilaginosa часто обнаруживается в ротовой полости и верхних дыхательных путях здоровых людей. Одновременно эта бактерия способна в редких случаях вызывать такие серьёзные заболевания, как эндокардит и менингит.

Rothia mucilaginosa присутствует в желудке у части больных Helicobacter pylori-ассоциированными заболеваниями желудка и у них она выявляется чаще других представителей рода роция (Hu Y et al., 2012).
Rothia mucilaginosa в систематике бактерий
По современной классификации вид Rothia mucilaginosa относится к роду Rothia, который входит в семейство Micrococcaceae, подпорядок Micrococcineae, порядок Actinomycetales, класс Actinobacteria, тип Actinobacteria, царство Бактерии.

пятница, 31 июля 2015 г.

Роции (Rothia)

Роции или Ротии (лат. Rothia) — род грамположительных неподвижных не образующих спор бактерий из семейства Micrococcaceae.
Rothia в организме человека
Представители рода Rothia входят в состав нормальной микрофлоры ротовой полости, респираторного тракта и желудка человека. Может быть причиной оппортунистических инфекций.

Rothia обнаруживается в желудках здоровых людей, неинфицированных и инфицированных Helicobacter pylori. При биопсии желудка больных Helicobacter pylori-ассоциированными заболеваниями были выделены следующие виды роций: Rothia mucilaginosa, Rothia dentocariosa, Rothia aeria и другие. Также обнаруживается при биопсии пищевода.
Rothia в систематике бактерий
По современной классификации род Rothia входит в семейство Micrococcaceae, подпорядок Micrococcineae, порядок Actinomycetales, класс Actinobacteria, тип Actinobacteria, царство Бактерии.

В род Rothia включены виды: Rothia aeria, Rothia amarae, Rothia arfidiae, Rothia dentocariosa, Rothia endophytica, Rothia mucilaginosa, Rothia nasimurium, Rothia terrae.

В прошлом вид Rothia mucilaginosa назывался Stomatococcus mucilaginosus и Micrococcus mucilaginosus.

среда, 15 июля 2015 г.

Бактерии рода Roseburia

Roseburia — род грамположительных или грамвариабельных анаэробных подвижных бактерий семейства Lachnospiraceae. Имеют вид слегка искривленных остроконечных палочек. Основные виды рода входят в состав микробиоты кишечника человека и впервые выделены из кала человека.

Бактерии этого рода Roseburia cecicola и Roseburia faecis являются одними из основных продуциентов масляной кислоты (бутиратов) в толстой кишке. Масляная кислота играет большую роль в физиологии, она является основным энергетическим материалом для эпителиоцитов, поддерживает кишечный гомеостаз, контролирует нормальное развитие клеток и предотвращает развития различных заболеваний кишечника.

Имеются исследования, показывающие, что уменьшение числа бактерий рода Roseburia ассоциировано с развитием артериосклероза, что предположительно, связано с уменьшением обладающими противовоспалительными свойствами бутиратов, продуцируемыми бактериями. 
Roseburia в систематике бактерий
В состав рода Roseburia входят следующие виды:
По современной систематике род Roseburia относится к семейству Lachnospiraceae, которое входит в порядок Clostridiales, класс Clostridia, тип Firmicutes, царство Бактерии.

воскресенье, 10 мая 2015 г.

Листерии


Листерии (англ. Listeria) — род грамположительных бактерий.

Listeria monocytogenesНаиболее известным представителем является Listeria monocytogenes — возбудитель листериоза, менингита, абсцесса головного мозга и других смертельно опасных болезней человека. Остальные виды листерий для человека или не опасны, или информация о вызванных ими заболеваний встречается очень редко. Предположительно, бактерии видов Listeria ivanovii, Listeria grayi, Listeria seeligeri также могут быть причиной заболеваний человека (известны только единичные случаи).

Более 90 % заболевших — представители групп риска: беременные, младенцы, лица старше 65 лет или страдающие имуннодефицитом.

Listeria ivanovii является патогеном жвачных животных, в основном, овец.


Листерии в систематике бактерий
По современной классификации род листерии (Listeria) относится к семейству Listeriaceae, которое входит в порядок Bacillales, класс Bacilli, тип Firmicutes, царство Бактерии.

К роду листерий отнесены следующие виды: Listeria aquatica, Listeria cornellensis, Listeria fleischmannii, Listeria floridensis, Listeria grandensis, Listeria grayi, Listeria innocua, Listeria ivanovii, Listeria marthii, Listeria monocytogenes, Listeria riparia, Listeria rocourtiae, Listeria seeligeri, Listeria weihenstephanensis, Listeria welshimeri.

среда, 29 апреля 2015 г.

Микрококки

Микрококки (Micrococcus) — род грамположительных бактерий. Имеют форму сферы от 0,5 до 3 мкм в диаметре. Микрококки неподвижны. В природе распространены повсеместно: в почве, пыли, в воде. Особенностью микрококков является способность к развитию при низких температурах.

Микрококки в организме человека
Большое количество микрококков обитает на коже человек, они также встречаются в дыхательных путях, в ротовой полости. Чаще всего микрококки не вызывают каких-либо заболеваний, однако они могут быть причиной оппортунистических инфекций, особенно у индивидуумов с ослабленным иммунитетом, например, у ВИЧ-инфицированных.
Микрококки в систематике бактерий
По современной классификации род Micrococcus входит в семейство Micrococcaceae, подпорядок Micrococcineae, порядок Actinomycetales, класс Actinobacteria, тип Actinobacteria, царство Бактерии.
Микрококки лютеус (Micrococcus luteus)
В род микрококки включены виды: Micrococcus antarcticus, Micrococcus cohnii, Micrococcus endophyticus, Micrococcus lactis, Micrococcus luteus, Micrococcus terreus, Micrococcus yunnanensis, Micrococcus flavus, Micrococcus lylae.

Некоторые ранее входившие в состав данного рода бактерии реклассифицированы и в настоящее время относятся к другим родам (семействам) и имеют иные названия: Micrococcus agilis (старое название) --> Arthrobacter agilis (новое); Micrococcus halobius --> Nesterenkonia halobia; Micrococcus kristinae --> Kocuria kristinae; Micrococcus roseus --> Kocuria rosea; Micrococcus varians --> Kocuria varians; Micrococcus nishinomiyaensis --> Dermacoccus nishinomiyaensis; Micrococcus sedentarius --> Kytococcus sedentarius.

понедельник, 20 апреля 2015 г.

Streptococcus pyogenes — причина заболеваний человека



Схематическое изображение строения клетки Streptococcus pyogenes, поверхностных и секретируемых факторов вирулентности (Шпынев К.В. и др.)
Схематическое изображение строения клетки Streptococcus pyogenes, поверхностных и секретируемых факторов вирулентности (Шпынев К.В. и др.)

Streptococcus pyogenes — вид грамположительных факультативно анаэробных β-гемолитических бактерий. По классификации R. Lancefield является стрептококком серогруппы A, распространённые аббревиатуры: БГСА, GAS и др. Клетки Streptococcus pyogenes имеют сферическую форму.
Streptococcus pyogenes — причина заболеваний человека
Streptococcus pyogenes — один из наиболее распространенных возбудителей бактериальных инфекций человека. Он вызывает такие заболевания как скарлатина, тонзиллит, фарингит, импетиго, рожистое воспаление, флегмоны, некротизирующий фасцит, миозит, артрит, синдром токсического шока. Streptococcus pyogenes является основной причиной фаринготонзиллитов у детей младшего школьного возраста и единственной причиной постинфекционных заболеваний — ревматизма и острого гломерулонефрита.
Фарингит, вызванный стрептококком
Фарингит, вызванный
стрептококком


Резервуаром для распространения Streptococcus pyogenes является только человек. Носителями этого микроба являются до 20 % населения. Чаще всего он обнаруживается на коже, во влагалище и в прямой кишке носителей. Передача инфекции от носителя чаще всего осуществляется воздушно-капельным путём.
Streptococcus pyogenes в систематике бактерий
По современным представлениям вид Streptococcus pyogenes относится к серогруппе A рода стрептококков, род стрептококки (Streptococcus) входит в семейство Streptococcaceae, порядок Lactobacillales, класс Bacilli, тип Firmicutes, царство Бактерии.
Антибиотики, активные в отношении Streptococcus pyogenes
Streptococcus pyogenesПри лечении стрептококкового тонзиллофарингита у детей предпочтительным является 10-дневный курс пенициллина. Учитывая низкую комплаентность пациентов при 10-дневном курсе, а также неодинаковую эффективность различных антибиотиков, могут быть рекомендованы что 6-дневный курс амоксициллина, 4–5-дневный курс цефалоспоринов, 5-дневный курс азитромицина или 5-дневный курс цефиксима (И. А. Дронов, Н. А. Геппе, У. С. Малявина, 2014).

Следующие антимикробные средства (из представленных в данном справочнике) активны в отношении Streptococcus pyogenesазитромицинкларитромицин, левофлоксацин, ципрофлоксацин, джозамицин, доксициклин, ванкомицин, амоксициллин.

пятница, 10 апреля 2015 г.

Actinomyces israelii и актиномикоз

Actinomyces israeliiActinomyces israelii — вид грамположительных факультативных анаэробных бактерий из рода актиномицетов. Обитает в почве, фекалиях, сточных водах, обитатели поверхности слизистых оболочек у млекопитающих. У человека Actinomyces israelii колонизируют слизистые оболочки полости рта и желудочно-кишечного тракта и влагалище. Actinomyces israelii становится патогенным, если он внедряется в инфицированные раны слизистой оболочки, особенно в сочетании с другими патогенными микроорганизмами. Инфекция, вызываемая Actinomyces israelii — актиномикоз встречается редко и обычно развивается у ослабленных людей.
Диагностика и лечение актиномикоза
При диагностики актиномикоза очень часто допускаются ошибки. Необходима дифференциальная диагностика с нокардиозом и со злокачественными опухолями. Правильный диагноз устанавливается чаще гистопатологически.

Антибактериальная терапия: пенициллин G 18–24 MIL единиц внутривенно, в течение 2–6 нед, затем перорально амоксициллин 500–750 мг по три или четыре раза в день в течение 6–12 месяцев; одна пероральная терапия может быть адекватной. Альтернатива: доксициклин 100 мг дважды в день внутривенно 2–6 недель, затем в течение 6–12 месяцев дважды в день по 100 мг перорально...

Подробнее о лечении актиномикоза и о чувствительности к антибактериальным средствам, см статью «Актиномицеты (Actinomyces)».
Actinomyces israelii в систематике бактерий
Ранее актиномицеты относились к грибам, позже, исходя из морфологии и биологических свойств они были реклассифицированы, как бактерии, и включены в семейство Actinomycetaceae.

По современной классификации вид Actinomyces israelii относится к роду Actinomyces, который  входит в семейство Actinomycetaceae, подпорядок Actinomycineae, порядок Actinomycetales, класс Actinobacteria, тип Actinobacteria, царство Бактерии.

четверг, 2 апреля 2015 г.

Актиномицеты в организме человека. Бактериальная карта тела человека.

Актиномицеты (лат. Actinomycetales) — порядок (лат. ordo) грамположительных бактерий.

Порядок Actinomycetales относится к классу Actinobacteria, типу Actinobacteria, царству Бактерии.

Бактерии порядка Актиномицеты (Actinomycetales) в организме человека

Представителей порядка Actinomycetales присутствуют среди микрофлоры толстой кишки человека, в частности, это бактерии следующих родов: Actinomyces, Corynebacterium, Propionibacterium. Однако перечисленные бактерии не являются основной микрофлорой кишечника (Ардатская М. Д., Минушкин О. Н.).

Actinomyces и Rothia обнаруживаются в желудке здоровых людей (при условии отсутствия в нём доминирующем количестве Helicobacter pylori). Rothia — в биопатах пищевода (Engstrand  L., 2012). Actinomyces, Corynebacterium, Micrococcus и Rothia входят в состав нормальной микрофлоры ротовой полости.

Большинство из обитающих на коже человека микроорганизмов — актиномицеты. Абсолютное большинство из них симбиоты, не причиняющее никакого вреда организму хозяина. Одним из исключений является вид пропионибактерий Propionibacterium acnes — возбудитель акне. Первые три места среди обитающих на коже человека актиномицетов занимают группы бактерий из подпорядков Corynebacterineae, Propionibacteriaceae и Micrococcineae (см. рисунок ниже).

Бактериальная карта кожи человека

 Бактериальная карта тела человека (по Julie A.Segre). Цвет наименования точки обозначает её тип:
синий — масляный, зелёный — влажный, красный — сухой

вторник, 24 марта 2015 г.

Актиномицеты (Actinomycetales). Подпорядки и семейства порядка Actinomycetales.






Актиномицеты (лат. Actinomycetales) — порядок (лат. ordo) грамположительных бактерий.

Порядок Actinomycetales относится к классу Actinobacteria, типу Actinobacteria, царству Бактерии.
Подпорядки и семейства порядка Actinomycetales
Порядок (ordo) Actinomycetales включает в свой состав следующие подпорядки (subordo) и семейства (внутри семейств выделены только некоторые роды и виды):
  • Actinomycineae
  • Actinopolysporineae
    • Actinopolysporaceae
  • Catenulisporineae
    • Actinospicaceae
    • Catenulisporaceae
  • Corynebacterineae
    • Corynebacteriaceae
    • Dietziaceae
    • Gordoniaceae
    • Mycobacteriaceae
      • Mycobacterium (микобактерии)
        • Mycobacterium leprae — возбудитель лепры
        • Mycobacterium tuberculosis — возбудитель туберкулёза
    • NocardiaceaeCorynebacterium diphtheriae - возбудители дифтерии
    • Segniliparaceae
    • Tsukamurellaceae
    • Williamsiaceae
  • Frankineae
    • Acidothermaceae
    • Cryptosporangiaceae
    • Frankiaceae
    • Geodermatophilaceae
    • Motilibacteraceae
    • Nakamurellaceae
    • Sporichthyaceae
  • Glycomycineae
    • Glycomycetaceae
  • Jiangellineae
    • Jiangellaceae
  • Kineosporiineae
    • Kineosporiaceae
  • Micrococcineae
    • Beutenbergiaceae
    • Bogoriellaceae
    • Brevibacteriaceae
    • Cellulomonadaceae
    • Demequinaceae
    • Dermabacteraceae
    • Dermacoccaceae
    • Dermatophilaceae
    • Intrasporangiaceae
    • Jonesiaceae
    • Microbacteriaceae
    • Micrococcaceae
    • Promicromonosporaceae
    • Rarobacteraceae
    • Ruaniaceae
    • Sanguibacteraceae
  • Micromonosporineae
    • Micromonosporaceae
  • Propionibacterium acnes — возбудители акне (угревой сыпи)Propionibacterineae
  • Pseudonocardineae
    • Pseudonocardiaceae
  • Streptomycineae
  • Стрептомицеты - представители порядка Actinomycetales
    • Streptomycetaceae
  • Streptosporangineae
    • Nocardiopsaceae 
    • Streptosporangiaceae
    • Thermomonosporaceae

пятница, 27 февраля 2015 г.

Гемофилюс (Haemophilus)

Гемофилюс (Haemophilus) — род грамотрицательных бактерий. Haemophilus имеют вид небольших палочек и неподвижны. Многие Haemophilus являются комменсалами в человеческом организме.

Haemophilus
обнаруживается в желудке здоровых людей (при условии отсутствия в нём в доминирующем количестве Helicobacter pylori) (Engstrand  L., 2012).
Бактерии Haemophilus — возбудители заболеваний человека
Мягкий шанкр, результат инфекции Haemophilus ducreyi
Мягкий шанкр. Возбудитель Haemophilus ducreyi
Некоторые виды Haemophilus вызывают серьёзные заболевания человека. В частности, Haemophilus influenzae, называемая также палочкой Пфейфера или гемофильной палочкой, является возбудителем так называемых гемофильных инфекций человека, включая гнойный менингит, острую пневмонию, септицимию, воспаления надгортанника, гнойный артит, перикардит, синуситы, отиты и другие заболевания дыхательных путей.

Haemophilus ducreyi является возбудителем венерического заболевания — мягкого шанкра.
Мозг, пораженный Haemophilus influenzae при менингите
Мозг при менингите,
вызванном Haemophilus influenzae


В редких случаях Haemophilus parainfluenzae, входящий в состав нормальной микрофлоры человека, может вызывать оппортунистические инфекции, в частности, эндокардиты у детей.
Haemophilus в систематике бактерий
Род Haemophilus входит в семейство Pasteurellaceae, порядок Pasteurellales, класс гамма-протеобактерии (лат. γ proteobacteria), тип протеобактерии (лат. Proteobacteria), царство Бактерии.

В род Haemophilus входят следующие виды: H. aegyptius (Koch-Weeks bacillus), H. ducreyi, H. haemoglobinophilus, H. haemolyticus, H. influenzae, H. influenzae-murium, H. paracuniculus, H. parahaemolyticus, H. parainfluenzae, H. paraphrohaemolyticus, H. parasuis, H. piscium, H. pittmaniae, H. quentini, H. simiae, H. sputorum.
Вакцины и антимикробные средства, активные а отношении Haemophilus
Hiberix - вакцина для профилактики заболеваний, вызванных Haemophilus influenzae типа bСледующие антибиотики (из числа представленных в настоящем справочнике) активны в отношении Haemophilus: В Анатомо-терапевтической-химической классификации (АТХ) в разделе «J07 Вакцины» имеется отдельный раздел «J07AG Вакцины против Haemophilus influenza B». В России допущены к применению три препарата–вакцины для профилактики заболеваний, вызванных Haemophilus influenzae типа b: Хиберикс (англ. Hiberix), Акт-ХИБ (англ. Act-HIB) и «Вакцина гемофильная тип b конъюгированная» (производство Ростовского НИИ микробиологии и паразитологии).

Инструкция фирмы-производителя вакцины против Haemophilus influenzae тип b для США на английском языке, pdf: «Hiberix [Haemophilus b Conjugate Vaccine (Tetanus Toxoid Conjugate)]», GlaxoSmithKline.