Хеликобактер (Helicobacter), род бактерий

Хеликобактер, геликобактер, геликобактерии или хеликобактерии (лат. Helicobacter) — род спиралевидных грамотрицательных подвижных микроаэрофильных бактерий, разные виды которого могут инфицировать слизистую оболочку желудка или кишечника, ануса, желчного пузыря, желчевыводящих путей, а также печень человека и/или животных и могут вызывать различные воспалительные заболевания, такие как гастриты, язвенную болезнь желудка и двенадцатиперстной кишки, колиты, проктиты и другие.

В отношении написания наименования данного рода бактерий на русском языке см. Циммерман Я.С. Нерешенные и спорные проблемы современной гастроэнтерологии.

«Энтерогепатические» и «желудочные» хеликобактеры

Бактерии их рода Helicobacter, в зависимости их локализации в организме хозяина, условно разделяют на «энтерогепатические» и «желудочные»:

• Большое число хорьков являются носителями H. mustelae — «желудочного» вида хеликобактерий, ассоциируемого с гастритом и пептической язвой у норок, горностаев и хорьков

  «желудочные» виды: клинически важнейший вид Helicobacter pylori, а также H. acinonychis, H. baculiformis, H. bizzozeronii, H. cetorum, H. cynogastricus, H. felis, H. heilmannii, H. mustelae, H. salomonis, H. suis и другие; «желудочные» хеликобактерии выделяются из слизистой оболочки желудка человека или животных, таких видов относительно немного, но в заболеваниях человека они играют главнейшую роль


• «энтерогепатические» виды: H. anseris, H. bilis, H. brantae, H. canis, H. canadensis, H. cholecystus, H. cinaedi, H. equorum, H. fennelliae, H. ganmani, H. hepaticus, H. marmotae, H. mastomyrinus, H. mesocricetorum, H. muridarum, H. pametensis,   H. pullorum, H. rodentium, H. salomonis, H. trogontum, H. typhlonius и другие; большинство видов хеликобактера является «энтерогепатическими» и обычно выделяются из слизистой оболочки кишечника, желчного пузыря, желчевыводящих путей, из печени организма хозяина. Большинство «энтерогепатических» хеликобактеров уреазоотрицательные и толерантны к действию желчи, что отличает их от «желудочных». Однако, подобное разделение не абсолютно. Иногда «энтерогепатические» бактерии выделяются из слизистой желудка и наоборот.

Некоторые авторы разделяют виды хеликобактера на «желудочные» и «внежелудочные», при этом список последних фактически совпадает со списком «энтерогепатических» видов.

Цитробактер фреунди (citrobacter freundii)

Citrobacter freundii — вид грамотрицательных, споронеобразующих, факультативно анаэробных бактерий. Представитель нормальной, условно-патогенной микрофлоры кишечника человека.

Citrobacter freundii в систематике бактерий

Вид citrobacter freundii относится к роду цитробактер (citrobacter), который входит в семейство энтеробактерии (enterobacteriaceae), порядок энтеробактерии (enterobacteriales), класс гамма-протеобактерии (γ proteobacteria), тип протеобактерии (proteobacteria), царство бактерии.

Citrobacter freundii — возбудитель заболеваний человека

Сitrobacter freundii имеется в толстой кишке у большинства здоровых людей. Однако, при попадании в другие органы, или при изменении (появлении дисбаланса) в составе микрофлоры кишечника, citrobacter freundii может стать причиной инфекционных гастроэнтеритов, острых кишечных инфекций, инфекций мочеполовой системы, желчного пузыря, среднего уха и других заболеваний.

Антибиотики, активные в отношении citrobacter freundii

Антибактериальные средства (из имеющих описание в данном справочнике), активные в отношении citrobacter freundii: левофлоксацин.

Цитробактер

Цитробактер (лат. citrobacter) — род грамотрицательных, споронеобразующих, факультативно анаэробных бактерий. Представитель нормальной, условно-патогенной микрофлоры кишечника человека.

 Сitrobacter в систематике бактерий

Род цитробактер (citrobacter) входит в семейство энтеробактерии (enterobacteriaceae), порядок энтеробактерии (enterobacteriales), класс гамма-протеобактерии (γ proteobacteria), тип протеобактерии (proteobacteria), царство бактерии.

Род цитробактер включает следующие виды: citrobacter amalonaticus, citrobacter braakii, citrobacter farmeri, citrobacter freundii, citrobacter gillenii, citrobacter koseri, citrobacter murliniae, citrobacter rodentium, citrobacter sedlakii, citrobacter werkmanii, citrobacter youngae.

Сitrobacter — возбудитель заболеваний человека и животных

Цитробактер является одной из самых частых причин внутрибольничных ангиогенных инфекций и инфекций мочевыводящих путей. Цитробактер способен вызывать вспышки гастроэнтеритов и токсикоинфекций, внутрибольничные инфекции, менингиты, абсцессы мозга, урологические заболевания, гнойные инфекции и сепсис у детей и взрослых людей. В регионах России в последние годы периодически происходят массовые отравления, в том числе в детских учреждениях, вызванные цитробактером, основной причиной которых является нарушение технологии приготовления пищи.

Источником инфекции являются люди и животные. Механизм передачи цитробактера — фекально-оральный. Основной путь передачи — пищевой, через молоко, молочные продукты, масло, кондитерские изделия, мясо птиц и животных. У ослабленных детей раннего возраста возможен контактно-бытовой путь заражения через игрушки, предметы ухода, руки персонала.

Цитобактериоз может протекать по типу пищевого отравления в виде гастрита, энтерита или гастроэнтерита. Инкубационный период цитробактериоза от 2 до 5 часов.

Гастрит начинается остро с тошноты, повторной рвоты, боли в эпигастральной области. Температура тела, чаще всего, в пределах от 37–37,5 до 38–38,5 ° С. Симптомы отравления выражены умеренно. Продолжительность — 1–2 дня.

Гастроэнтерит начинается остро с тошноты, повторной рвоты, болей в животе. Стул частый, жидкий, иногда с примесью слизи, до 10 раз в сутки. Боль в животе в первые дни болезни может быть выраженной, локализуется преимущественно в эпигастральной области, при пальпации определяется болезненность по ходу тонкой кишки. Понос, чаще всего, на несколько часов опережает развитие симптомов отравления. Температура тела повышается до 38° С, сохраняется не более 5 дней. Прогноз благоприятный, продолжительность цитробактериоза — от 4 до 6 дней.

Диагноз на цитробактериоз устанавливается после проведения специальных лабораторных исследований.

Цитробактер способен самостоятельно или в ассоциации с другими микробами вызывать заболевания у домашних и диких животных, рыб и пчел. В современной России имеются прецеденты, когда циторбактер выявляли в фабрично изготовленном комбикорме. Корма, зараженные цитробактером или с подозрением на цитробактер требуют обязательной проварки при температуре не ниже 100° С не менее часа.

Рекомендуем материалы Роспотребнадзора «О профилактике пищевых отравлений и инфекционных болезней, передающихся с пищей» и ВОЗа «Руководство по безопасным пищевым продуктам для туристов».

Цитробактер в результатах анализа кала на дисбактериоз

При микробиологическом анализе кала цитробактер рассматривается в комплексе с другими условно-патогенными бактериями, относящимися к семейству энтеробактерий и входящими в состав нормальной микрофлоры кишечника человека (кроме цитробактера это клебсиелла, протей, гафния, серратия, морганелла, провиденция, энтеробактер и др). В норме общее количество этих бактерий (колониеобразующих единиц, КОЕ) в 1 г кала должно быть меньше 10⁴. Большее количество перечисленных бактерий является признаком дисбактериоза.

При избыточном росте цитробактера, как следствии дисбактериоза, при медикаментозной терапии применяются различные пробиотки (Бифидумбактерин, Бифиформ, Лактобактерин, Ацилакт, Аципол и др.) и/или адекватные конкретному штамму цитробактера и причине дисбактериоза бактериофаги и антибиотики.

На сайте www.gastroscan.ru в каталоге литературы имеется раздел «Дисбиоз» , содержащий статьи, затрагивающие проблемы дисбактериозов органов ЖКТ.

Антибиотики, активные и неактивные в отношении цитробактера

Антибактериальные средства (из имеющих описание в данном справочнике), активные в отношении цитробактера: нифуроксазид, ципрофлоксацин. В отношении citrobacter koseri и citrobacter freundii активен левофлоксацин.

Цитробактер устойчив к рокситромицину.

Коринебактерии дифтерии

Corynebacterium diphtheriae (называемая в прошлом дифтерийной палочкой) — вид грамположительных бактерий рода коринебактерии. Сorynebacterium diphtheriae — возбудители дифтерии. Имеют вид прямых, слегка изогнутых палочек, длиной от 1 до 8 мкм и толщиной от 0,3 до 0,8 мкм.

Corynebacterium diphtheriae в систематике бактерий

По современной классификации вид corynebacterium diphtheriae входит в род коринебактерии (лат. Corynebacterium), который относится к семейству Corynebacteriaceae, подпорядку Corynebacterineae, порядку Actinomycetales, классу Actinobacteria, типу Actinobacteria, царству Бактерии.

Статистика заболеваемости дифтерией

Согласно официальным данным, число зарегистрированных случаев заболеваний дифтерией в Российской Федерации за 2009 и 2010 годы, в том числе среди детей и подростков до 17 лет включительно, следующая:

	Всего		от 0 до 17 лет
год:	2009	2010	2009	2010
Российская Федерация	14	9	2	3
Центральный ФО	6	1	1	0
г. Москва	3	0	1	0
Северо-Западный ФО	0	0	0	0
г. Санкт-Петербург	0	0	0	0

За 2011 год зарегистрировано 7 случаев дифтерии — по 1 случаю в Удмуртской Республике, Пермском крае, Ивановской, Калужской, Московской, Оренбургской и Иркутской областях.

Антибиотики, активные в отношении corynebacterium diphtheriae

Антибактериальные средства (из имеющих описание в данном справочнике), активные в отношении corynebacterium diphtheriae: джозамицин, кларитромицин, ванкомицин, линкомицин. Corynebacterium diphtheriae резистентны к ципрофлоксацину.

Коринебактерии

Коринебактерии (лат. corynebacterium) — род грамположительных палочкообразных бактерий.

Коринебактерии вида corynebacterium diphtheriae являются возбудителями одной из наиболее известных инфекций человека — дифтерии.

Коринебактерии присутствуют в норме в толстой кишке человека (Ардатская М. Д., Минушкин О. Н.).

В зависимости от биологических особенностей разные виды коринебактерий способны поражать кожу и внутренние органы, особенно у пожилых людей, пациентов с иммуносупрессией или мультиорганной патологией. В случаях инфицирования венозных или брюшных катетеров, нейрохирургических шунтов наблюдается бактериемия. Многие представители коринебактерий становятся причиной эндокардитов, пневмоний, септического артрита и остеомиелита, инфекций при протезировании, заболеваний мочеполовой системы.

Непатогенные виды коринебактерий используются в промышленности для производства аминокислот, нуклеотидов, ферментов, биоконверсии стероидов и производстве сыров.  Одним из наиболее изученных видов коринебактерий corynebacterium glutamicum применяется при биосинтезе глютаминовой кислоты.

Виды Corynebacterium ammoniagenes и Corynebacterium flavescens разрешены СанПиН 2.3.2.2340-08, утвержденным Постановлением Главного государственного санитарного врача РФ 18 февраля 2008 г. № 13, для использования в пищевой промышленности.

Коринебактерии (corynebacterium) в систематике бактерий

По современной классификации род коринебактерии входит в семейство Corynebacteriaceae, подпорядок Corynebacterineae, порядок Actinomycetales, класс Actinobacteria, тип Actinobacteria, царство Бактерии.

В род коринебактерии входят следующие виды: C. accolens, C. afermentans, C. ammoniagenes, C. amycolatum, C. argentoratense, C. appendicis, C. aquilae, C. auris, C. atypicum, C. aurimucosum,  C. auriscanis, C. bovis, C. diphtheriae, C. equi, C. flavescens, C. glucuronolyticum, C. glutamicum, C. granulosum, C. haemolyticum, C. halofytica, C. jeikeium, C. macginleyi, C. matruchotii,  C. minutissimum, C. parvum, C. propinquum, C. pseudodiphtheriticum, C. pseudotuberculosis, C. pyogenes, C. urealyticum, C. renale, C. spec, C. striatum, C. tenuis, C. ulcerans, C. urealyticum, C. xerosis.

Большинство видов коринебактерий являются нелиполитическими. Нелиполитические бактерии подразделяются на ферментирующие и неферментирующие: 

• Нелиполитические коринебактерии
• Ферментирующие коринебактерии:
• Corynebacterium diphtheriae group
• Corynebacterium xerosis
• Corynebacterium striatum
• Corynebacterium minutissimum
• Corynebacterium amycolatum
• Corynebacterium glucuronolyticum
• Corynebacterium argentoratense
• Corynebacterium matruchotii
• Неферментирующие коринебактерии:
• Corynebacterium afermentans subsp. afermentans
• Corynebacterium auris
• Corynebacterium pseudodiphtheriticum
• Corynebacterium propinquum

• Липолитические коринебактерии
• Corynebacterium jeikeium
• Corynebacterium urealyticum
• Corynebacterium afermentans subsp. lipophilum
• Corynebacterium accolens
• Corynebacterium macginleyi
• CDC coryneform groups F-1 и G

Антибиотики, активные в отношении коринебактерий

Антибактериальные средства (из имеющих описание в данном справочнике), активные в отношении коринебактерий: кларитромицин, азитромицин. Ванкомицин и джозамицин активны в отношении corynebacterium diphtheriae. Коринебактерии резистентны к ципрофлоксацину.

Возбудитель внутрибольничных инфекций Acinetobacter baumannii

Acinetobacter baumannii — вид грамотрицательных споронеобразующих неферментирующих строго аэробных бактерий.

Acinetobacter baumannii широко распространены в природе, а также во внутрибольничной среде и обладают множественными механизмами резистентности к антибиотикам. Acinetobacter baumannii могут колонизировать желудочно-кишечный тракт, кожу пациента, рото- и носоглотку, конъюнктиву, влагалище и уретру.

В то же время Acinetobacter baumannii могут являться причиной пневмонии, трахеобронхита, сепсиса, инфекций мочевыводящих путей, эндокардита, раневой и хирургической инфекции, инфекций кожи и мягких тканей (включая некротизирующий фасциит), менингита, вентрикулита, абсцессов мозга, интраабдоминальных абсцессов, хориоамнионита, остеомиелита, артрита, синусита и перитонита.

Acinetobacter baumannii — возбудитель внутрибольничных инфекций

Проблема нозокомиальных (внутрибольничных) инфекций, вызываемых Acinetobacter baumannii, становится всё более актуальной из-за растущей резистентности данных микроорганизмов к антибактериальным препаратам. Резистентность Acinetobacter baumannii к цефтазидиму и ампициллину/сульбактаму за 5 лет увеличилась в 2–2,5 раза, к амикацину и ципрофлоксацину — в 8–9 раз. Встречаются штаммы, резистентные ко всем применяемым антибактериальным препаратам. Появление таких устойчивых внутрибольничных микроорганизмов связано с необоснованным и неограниченным использованием антибиотиков.

Acinetobacter baumannii вызывает 2-10 % всех грамотрицательных инфекций в Европе и США и до 1% всех внутрибольничных инфекций. В России Acinetobacter baumannii, наряду с Pseudomonas aeruginosa и Klebsiella pneumoniae, относится к трём самым часто происходящим и опасным возбудителям нозокомиальных инфекций. Во внутрибольничных условиях вспышки инфекций, вызываемые Acinetobacter baumannii в 60% случаев происходят во «взрослых» отделениях реанимации и интенсивной терапии. Оставшиеся 40% приходятся на отделения реанимации и интенсивной терапии новорожденных, ожоговые, нейрохирургические, хирургические, онкологические и гематологические отделения. Способствующими факторами являются: организация работы в этих отделениях – широкое использование инвазивных диагностических и лечебных мероприятий (катетеризация магистральных сосудов, искусственная вентиляция лёгких, длительная инфузионная терапия, энтеральное питание, методы внепочечного очищения крови), высокая концентрация больных с тяжелыми заболеваниями и сниженной иммунологической защитой, широкое и часто нерациональное использование антибактериальных и кортикостероидных препаратов, цитостатиков. Acinetobacter baumannii в большинстве случаев вызывает заболевания у тяжелобольных иммуноскомпрометированных пациентов (Ю.Л. Горбич, И.А. Карпов, 2012).

Acinetobacter baumannii в систематике бактерий

По современным представлениям вид Acinetobacter baumannii входит в род ацинетобактеры (лат. Acinetobacter), который относится к семейству Moraxellaceae, порядку Pseudomonadales, классу гамма-протеобактерии (Gamma proteobacteria), типу протеобактерии (Proteobacteria), царству бактерии.

Антибиотики, активные в отношении Acinetobacter baumannii

В течение многих лет основой терапии инфекций, вызванных Acinetobacter baumannii, были бета-лактамные антибиотики, часто в сочетании с аминогликозидами в случаях тяжелых инфекций. Однако большинство внутрибольничных Acinetobacter baumannii в настоящее время устойчивы к этим препаратам. Фторхинолоны, тетрациклины и глицилциклин, триметоприм-сульфаметоксазол, карбапенемы (за исключением эртапенема), полимиксины могут сохранять активность в отношении некоторых внутрибольничных штаммов. Однако в большинстве стран наблюдается быстрое нарастание резистентности к этим группам антибиотиков. В настоящее время наиболее клинически и финансово эффективным является использование монотерапии ампициллином/сульбактамом в дозах 24 г/сут или комбинированных режимов, включающих карбапенемы и ампициллин/сульбактам или карбапенемы и цефоперазон/сульбактам и нетилмицин. Последняя комбинация является экономически менее выгодной (Н.Д. Дмитриева и др., 2012).

Из представленных в данном справочнике антимикробных средств в отношении Acinetobacter baumannii (в общем) активны: левофлоксацин, нифурател, доксициклин. Acinetobacter baumannii устойчив к рокситромицину.

Чумная палочка

Чумная палочка (Yersinia pestis) — вид грамотрицательных споронеобразующих бактерий, факультативных анаэробов. Возбудитель бубонной чумы, пневмонии (легочной формы чумы) и септической чумы.

Yersinia pestis в систематике бактерий

Вид иерсиния пестис (чумная палочка) относится к роду иерсинии (Yersinia), который входит в семейство энтеробактерии (Enterobacteriaceae), порядок энтеробактерии (Enterobacteriales), класс гамма-протеобактерии (γ proteobacteria), тип протеобактерии (Proteobacteria), царство бактерии.

Антибиотики, активные в отношении Yersinia pestis

Антибактериальные средства (из имеющих описание в данном справочнике), активные в отношении Yersinia pestis: доксициклин, тетрациклин.

Чума человека

У человека чума характеризуется внезапным повышением температуры и недомоганием, которое может сопровождаться болью в животе, тошнотой и рвотой. Есть три основные формы чумы, зависящие от способа заражения:

• Бубонная чума, как результат укуса инфицированной блохи, составляет примерно 80% -85% случаев; у пациентов развивается болезненный отек одного или нескольких лимфатических узлов, прогрессирующий в течение первых нескольких дней болезни.
• Септическая чума, что составляет примерно 10% случаев, которая может произойти от блошиного укуса или от прямого контакта с инфицированными жидкостями; инфекция распространяется непосредственно через кровь без каких-либо локализующих признаков.
• Лёгочная чума. Первичная легочная чума происходит примерно в 3% заболеваний чумой; возникает в результате аэрозольного воздействия инфекционный капель и характеризуется молниеносной первичной пневмонией. Вторичная легочная чума может возникнуть от распространения Yersinia pestis в легкие больного с необработанной бубонной или септической инфекцией.

Смертность от чумы при отсутствии лечения составляет от 63 % до 93%. При лечении современными антибиотиками — примерно 16 %. Своевременное лечение с применением антимикробных препаратов, таких как аминогликозиды, фторхинолоны или доксициклин, значительно увеличивает вероятность благоприятного исхода.

Чума человека в США

Согласно релиза Centers for Disease Control and Prevention (CDC), США от 25 августа 2015 года в США за период с 2001 по 2012 годы в год регистрировалось от 1 до 17 случаев заражения людей чумой (в среднем три случая в год). В период с 1 апреля 2015 года (до 25 августа 2015) зарегистрировано 11 случаев чумы человека в 6 штатах (возбудитель Yersinia pestis). 2 случая связывают с посещением Национального парка Йосемити в Калифорнии. 3 больных (возраст 16, 52 и 79 лет) скончались. Причина резкого увеличения заболеваемости чумой в 2015 году в США, как отмечается в упомянутом релизе, не понятна.

Yersinia pestis в МКБ-10

Yersinia pestis упоминается Международной классификации болезней МКБ-10 в «Классе I. Некоторые инфекционные и паразитарные болезни», в блоке «A20-A28 Некоторые бактериальные зоонозы», где имеется трёхсимвольная рубрика «A20 Чума» с расшифровкой, что в неё включена инфекция, вызванная Yersinia pestis. В эту рубрику входят четырёхсимвольные рубрики:

• A20.0 Бубонная чума
• A20.1 Целлюлярнокожная чума
• A20.2 Лёгочная чума
• A20.3 Чумной менингит
• A20.7 Септическая чума
• A20.8 Другие формы чумы  (с расшифровкой: Абортивная чума. Бессимптомная чума .Малая чума)
• A20.9 Чума неуточнённая

Небольшая мутация Yersinia pestis изменила историю человечества?

В статье, опубликованной в 2015 году в журнале Nature Communications, Dr. D.Zimbler и Dr. W. Lathem из Northwestern University (США) описали обнаруженную ими единственную генетическую особенность Yersinia pestis, которая принципиально изменила в свое время ход эволюции микроорганизма и историю человечества. В прошлом Yersinia pestis  не могла вызвать лёгочные формы чумы. Приобретение единственного гена  поверхностного белка Pla привело к превращению Yersinia pestis из патогена, вызывающего кишечные инфекционные заболевания, в микроорганизм, связанный с развитием тяжелых и летальных инфекций органов дыхания.